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Metagenomics 미생물 실험보고서2025.05.061. Metagenomics Metagenomics는 현재 약 99%의 미생물배양이 어렵다는 실험적인 한계를 보완하는 방법으로 직접환경샘플에서 DNA를 추출하여 Next-generationsequencing(NGS)를 진행하여 다양한 플랫폼을 이용하여 미생물의 군집구조(microbial community) 및 메타유전체(metagenome)를 분석하는데 이용되고 있다. 2. 토양 샘플 분석 이번 실험에서는 주변환경의 토양 sample을 채취하여 유전체 분석을 하는 방법을 이용했으며, 실험 과정은 토양 sample채취, 토양 samp...2025.05.06
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새로운 박테리아 종 동정을 위한 DNA 추출2025.05.081. DNA 추출 과정 본 실험에서는 미지 균주의 DNA를 추출하는 과정을 수행하였다. 균주를 PBS에 현탁하고 원심분리하여 세척한 뒤, lysozyme과 SDS를 처리하여 세포를 용균시켰다. 이후 PCI, chloroform을 이용하여 단백질과 불순물을 제거하고 에탄올 침전을 통해 DNA를 회수하였다. 최종적으로 0.1x SSC 완충액에 녹여 DNA 농도를 측정하였다. 그러나 260/280, 260/230 비율이 이상적인 수준에 미치지 못하여 순수한 DNA 추출에는 어려움이 있었던 것으로 나타났다. 2. DNA 추출 시약의 역할 ...2025.05.08
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마우스 꼬리로부터 게놈 DNA 추출 및 분석2025.01.041. 게놈 DNA 추출 실험을 통해 마우스 꼬리에서 게놈 DNA를 추출하는 과정을 이해하였습니다. 세포 용해, DNA 정제, 농도 측정 등의 단계를 거쳐 순도 높은 게놈 DNA를 얻을 수 있었습니다. 이 과정에서 주의해야 할 점들, 예를 들어 과도한 tapping이나 오염물질 혼입 등을 확인하였습니다. 2. DNA 전기영동 추출한 게놈 DNA를 아가로스 겔 전기영동을 통해 분석하였습니다. 10,000 bp 이상의 큰 DNA 단편이 가장 뚜렷하게 관찰되었지만 번진 모습(smear)을 보였고, 그 외에도 1,000-2,000 bp 및 ...2025.01.04
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생명공학실험 genomic dna preparationc 예비레포트2025.05.031. DNA (Deoxyribonucleic Acid) DNA는 자연계에 존재하는 2종류의 핵산 중 디옥시리보오스를 함유한 것의 총칭을 말하며, 디옥시리보핵산(Deoxyribonucleic Acid)의 약칭이다. DNA는 뉴클레오타이드의 중합체인 2개의 긴 가닥이 서로 꼬여 있는 이중나선구조로 고분자 화합물이다. DNA의 기본 단위는 뉴클레오타이드이며, 뉴클레오타이드는 염기, 당, 인산으로 구성된다. 2. DNA preparation 종류 DNA에는 Genomic DNA, Plasmid DNA, Phage DNA, cDNA (com...2025.05.03
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[만점보고서]Plasmid DNA 추출과 DNA 정량 실험보고서2025.01.171. Plasmid DNA 추출 Plasmid DNA는 세균의 세포 내에서 염색체와 별개로 존재하는 자가복제 DNA이다. Plasmid DNA 추출을 위해 Alkaline Lysis 법을 사용하여 세포를 용해시키고 plasmid DNA를 염색체 DNA와 분리한다. 이 과정에서 다양한 buffer를 사용하여 pH 변화를 조절하고 불순물을 제거한다. 2. DNA 정량 Nanodrop 분광광도계를 이용하여 추출한 plasmid DNA의 농도와 순도를 측정한다. 260nm 흡광도로 DNA 농도를 측정하고, 260nm/280nm 및 260n...2025.01.17
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인천대학교 나노바이오실험(1) Genomic DNA prep & Gel Electrophoresis2025.01.141. Genomic DNA Genomic DNA는 염색체 DNA로, Plasmid DNA와 같은 Extra-chromosomal DNA와 대조되는 개념이다. 대부분의 생물은 모든 세포에서 같은 Genomic DNA를 갖지만, 특정 gene의 발현으로 cell type과 function이 달라진다. 어떤 organism의 genomic DNA인지에 따라 바이러스, 박테리아, 진핵생물 등의 특성을 지닌다. 2. DNA 추출 방법 DNA 추출은 Lysis, Precipitation, Purification 3단계로 이루어진다. Lysis...2025.01.14
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박테리아에서 DNA 분리2025.01.271. plasmid DNA 분리 실험 목적은 plasmid DNA 분리에 대해 이해하고, 그 과정 중 하나인 plasmid mini-preparation에 대해 알아보는 것이다. plasmid DNA 분리법의 공통적인 세 단계는 overnight culture, mini preparation, 순수한 plasmid DNA 분리 과정이다. mini-prep은 plasmid DNA를 소량 분리하는 방법으로, 알칼리 조건에서 세포를 파괴시켜 DNA만을 분리하는 것이다. 2. plasmid DNA 분리 시약 실험에 사용된 시약은 LB 배지...2025.01.27
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일반생물학실험 결과레포트 [실험9] 핵산과 단백질 정량2025.05.131. 핵산 정량 실험을 통해 추출한 plasmid DNA의 농도를 spectrophotometer로 측정하였다. 측정 결과 DNA 농도는 52.00ug/ml로 나타났다. DNA의 순도를 확인하기 위해 A260/A280과 A260/A230 비율을 계산하였다. A260/A280 비율은 2.080으로 순수한 DNA 범위인 1.8-2.0을 벗어나 있어 DNA가 손상되었거나 오염되었음을 알 수 있다. A260/A230 비율은 0.881로 순수한 DNA 범위인 2.0-2.2를 크게 벗어나 있어 EDTA, 탄수화물, 유기용매 등의 오염이 있는 ...2025.05.13
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플라스미드 DNA 정제2025.01.121. 플라스미드 DNA 분리 플라스미드 DNA는 재조합 DNA 조작을 위한 운반체 DNA로 사용되며, 대장균에 플라스미드를 삽입하는 과정을 Bacterial Transformation이라고 한다. 대장균 세포에는 플라스미드 DNA와 염색체 DNA가 독립적으로 존재하므로, 플라스미드 DNA를 따로 분리하는 과정을 Purification of plasmid DNA라고 한다. 알칼리 용해법(Alkali lysis)은 높은 pH의 알칼리성 용액을 사용하여 세포벽과 세포막을 용해시킨 후, 산성 용액을 처리하여 플라스미드 DNA만을 분리해내는...2025.01.12
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DNA 추출 및 전기영동2025.01.121. DNA 추출 바나나에서 DNA를 추출하는 과정을 설명합니다. 바나나를 으깨고 소금, 세제를 섞어 세포벽을 파괴하여 DNA를 추출합니다. 에탄올을 사용하여 DNA를 침전시키고 물에 녹여 관찰할 수 있습니다. DNA는 음전하를 띠는 거대분자이며 뉴클레오타이드로 구성되어 있습니다. 2. 전기영동 추출한 DNA를 전기영동 실험을 통해 분리할 수 있습니다. 아가로즈 겔을 만들고 DNA 샘플에 loading buffer를 섞어 겔의 well에 로딩합니다. 전기장을 걸면 DNA가 음전하를 띠므로 양극 방향으로 이동하게 됩니다. DNA의 크...2025.01.12
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