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서울대학교, 화학실험, 만점, A+, 펩타이드 질량분석 결과보고서2025.01.291. MALDI-TOF 펩타이드 질량분석 본 실험에서는 trypsin으로 가수분해한 단백질 샘플을 MALDI-TOF MS로 분석하여, 미지의 샘플이 lysozyme, BSA, ovalbumin 중 어떤 단백질에 해당하는지 알아내고자 하였다. 실험 결과, 미지의 단백질은 BSA로 확인되었으며, MALDI-TOF MS 데이터 분석 시 peptide coverage, miscleavage, 신호 대비 잡음 비율(S/N) 등을 고려하여 정확도를 높이는 것이 중요함을 알 수 있었다. 2. 펩타이드 질량지문(PMF) 단백질을 trypsin으로...2025.01.29
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생체 분자의 질량 분석: Tandem MS를 이용한 Substance P 펩타이드 분석2025.11.181. 질량 분석법(Mass Spectrometry) 질량 분석법은 시료의 분자들을 이온화시켜 질량 대 전하량(m/z)에 따라 분류하고 그 양을 측정하는 분석법이다. 매우 적은 양의 시료로도 분석이 가능하며, 고분별능 질량 분석법을 이용하면 불순물이 존재해도 정확한 분자식을 알 수 있다. 질량 분석기는 고진공 상태에서 분자를 이온화시켜 질량에 따라 분류하고, 질량 스펙트럼은 m/z를 x축으로, 이온의 상대적 양을 y축으로 한 그래프이다. 주요 이온화 방법으로는 전자 충돌 이온화(EI)와 자기 편향을 이용한 이온 분리가 있다. 2. 이...2025.11.18
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Peptide 질량분석2025.01.231. 펩타이드 질량분석 단백질은 20종류의 아미노산들이 여러 개 연결된 폴리펩타이드 사슬이며, 펩타이드는 둘 이상의 아미노산이 탈수축합반응을 통해 결합된 것이다. MALDI-TOF 질량분석법은 분석 물질에 자외선을 흡수하는 matrix를 넣고 레이저로 기화시켜 기체상 이온을 만들어 질량/전하수 값을 측정하는 방법이다. 실험에서는 단백질을 트립신으로 가수분해한 펩타이드 용액을 CHCA matrix와 혼합하여 MALDI-TOF 질량분석을 수행하였고, 얻어진 펩타이드 질량지문으로부터 주어진 단백질을 동정하였다. 2. MALDI-TOF 질...2025.01.23
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연세대학교 생화학실험(1) 6주차 Peptide Mass Fingerprinting In-gel Digestion2025.05.041. Peptide Mass Fingerprinting (PMF) Peptide Mass Fingerprinting (PMF)은 단백질 동정을 위한 기술로, 단백질을 효소로 절단하여 생성된 펩타이드의 질량을 측정하고 데이터베이스와 비교하여 단백질을 식별하는 방법입니다. 이 기술은 SDS-PAGE를 통해 분리된 단백질 밴드에서 시작되며, 밴드를 절단하고 효소로 소화하여 생성된 펩타이드의 질량을 질량분석기로 측정합니다. 이렇게 얻은 펩타이드 질량 데이터를 데이터베이스와 비교하여 단백질을 동정하게 됩니다. 2. In-gel Digesti...2025.05.04
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[만점 레포트] 연세대학교 생화학실험(1) 7주차 Peptide Mass Finger-Printing2025.05.041. MALDI-TOF 질량분석법 MALDI-TOF 질량분석법은 고분자 물질에 대해 시료의 분해 없이 기화/이온화가 가능한 방법으로, 일반적으로 질량이 크고 열에 불안정한 생체 고분자나 합성 고분자에 이상적으로 적용할 수 있다. 이 실험에서는 MALDI 이온화 장치와 TOF 질량 분석기를 이용하여 단백질을 동정하는 방법을 공부한다. 2. 단백질 동정 MALDI-TOF 질량분석법을 이용하여 단백질을 동정하는 과정을 설명한다. 시료를 MALDI 장치에 주입하고 질량 분석기로 분석한 후, 결과 스펙트럼을 데이터 검색 엔진에 입력하여 단백...2025.05.04
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[만점 레포트] 연세대학교 생화학실험(1) 3주차 아미노산의 분리 및 정성분석2025.05.041. 아미노산의 분리 및 정성분석 이 실험에서는 Ninhydrin 반응을 이용하여 아미노산, 펩타이드, 단백질의 발색 특성을 관찰하고, 종이 크로마토그래피와 전기영동을 통해 아미노산을 분리 및 정성 분석하는 방법을 익히는 것이 목적입니다. 실험 결과를 통해 Ninhydrin 반응의 원리, 아미노산의 분리 및 정성 분석 방법, 펩타이드의 전기이동도 차이 등을 이해할 수 있습니다. 2. Ninhydrin 반응 Ninhydrin은 아미노산, 펩타이드, 단백질과 반응하여 특유의 발색 반응을 일으킵니다. 이 반응은 pH 4~8, 100°C ...2025.05.04
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식품생화학 아미노산, 펩타이드, 단백질 요약2025.05.071. 아미노산과 펩타이드 아미노산은 단백질을 이루는 기본단위 물질로서, 20개 다른 종류의 아미노산이 결합하여 펩타이드를 이루고 단백질을 형성합니다. 아미노산은 극성 아미노산(중성, 산성, 염기성)과 비극성 아미노산으로 구분되며, 중성 pH 상태에서 양극성 이온 형태로 존재합니다. 펩타이드는 아미노산이 펩타이드 결합으로 연결된 구조이며, 일부 펩타이드는 고유의 생리활성을 가지고 있습니다. 대표적인 합성 펩타이드인 아스파탐은 감미료로 사용되고 있습니다. 2. 단백질 구조 단백질은 아미노산이 중합된 고분자 물질로, 1차 구조(아미노산 ...2025.05.07
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광대버섯에서 발견된 팔로이딘의 구조, 생합성, 생화학적 기능 및 용도2025.01.171. 팔로이딘의 소개 팔로이딘(Phalloidin)은 광대버섯(Amanita phalloides) 속의 독버섯에서 발견된 물질로, 7개의 아미노산으로 구성된 두고리 화합물(bicyclic heptapeptide)이다. 팔로이딘은 F-actin(꼬인 섬유성 액틴)에 선택적으로 결합하여 필라멘트 말단으로부터 액틴 단량체의 해리를 억제하여 액틴 중합체를 안정화하는 기능을 한다. 2. 팔로이딘의 발견과 배경 팔로이딘은 최초의 고리형 펩타이드 중 하나이다. 1937년 Feodor Lynen과 Ulrich Wieland가 광대버섯에서 분리하여...2025.01.17
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레닌저 생화학 정리노트 Ch03. 아미노산 펩타이드 단백질2025.05.101. 아미노산 아미노산은 아미노기와 카복실기를 포함하고 있으며 두 작용기는 a-carbon에 의하여 연결됩니다. a-carbon은 4개의 치환기(substitunents)를 가지기 때문에 사면체(tetrahedral)이며 손대칭 중심(chiral center)입니다. 아미노산은 R기의 특성에 따라 5가지 기본 그룹으로 나뉘어질 수 있습니다: 비극성 지방족, 방향족, 극성 비전하, 양전하, 음전하. 아미노산은 최소 2개의 이온화 가능한 양성자를 가지고 각각의 pKa 값을 가지며, 화학적 환경이 pKa에 영향을 줍니다. 아미노산은 낮은...2025.05.10
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일반생물학실험 <단백질 검출> 예비레포트2025.01.271. 단백질 단백질은 아미노산의 펩타이드 결합으로 생긴 종합체로, 세포 내외부의 다양한 기능을 수행합니다. 단백질의 구조는 1차, 2차, 3차, 4차 구조로 이루어져 있으며, 이러한 구조에 따라 단백질의 기능이 결정됩니다. 단백질은 세포 내외부의 지지, 운동 조절, 신호 전달, 물질 수송 등의 역할을 합니다. 2. 아미노산 아미노산은 단백질의 기본 구성단위로, 카복실기와 아미노기를 포함한 분자입니다. 총 20종류의 서로 다른 아미노산이 존재하며, 이들이 펩타이드 결합을 통해 연결되어 단백질을 형성합니다. 3. 펩타이드 결합 펩타이드...2025.01.27
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