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레닌저 생화학 정리노트 Ch04. 단백질의 3차원 구조2025.05.101. 단백질의 3차원 구조 단백질의 3차원 구조는 주로 약한 상호작용에 의해 안정화되며, 4단계로 구성됩니다. 1단계는 아미노산이 공유적으로 연결되는 것이고, 2단계는 3차원 배열인 a 나선과 b 시트 형태입니다. 3단계는 단백질 사슬과 보결분자단을 포함한 모든 원자의 3차원 배열이며, 4단계는 subunits의 배열입니다. 단백질의 3차원 구조는 specific biological function을 결정하며, 이를 native fold라고 합니다. 단백질에서 다수의 호의적인 상호작용, 즉 소수성 효과, 수소 결합, London d...2025.05.10
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인공지능을 물리적 사물, 디지털 사물, 생물학적 존재에 적용한 사례2025.01.181. 물리적 사물에 적용된 인공지능 인공지능 기술은 물리적 사물, 특히 자율주행 자동차 분야에서 큰 변화를 가져왔다. 대표적인 예로 테슬라(Tesla)의 자율주행 시스템인 오토파일럿(Autopilot)을 들 수 있다. 테슬라의 오토파일럿은 AI를 활용하여 차량의 주변 환경을 실시간으로 인식하고 분석한다. 이 시스템은 차량에 장착된 8개의 카메라, 12개의 초음파 센서, 레이더를 통해 수집된 데이터를 바탕으로 주행 경로를 결정한다. 오토파일럿은 차선 유지, 자동 차간 거리 조절, 자동 차선 변경, 자동 주차 등의 기능을 제공하며, 고...2025.01.18
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생명과학분야에서의 인공지능 활용 - Alphafold를 중심으로2025.05.081. 단백질 구조 예측의 중요성 단백질은 여러 개의 아미노산이 서열을 이루고 결합한 것이다. 단백질의 구조를 알아내는 것이 현대 생물학에서 매우 중요하다. 단백질의 구조에 따라 기능과 작동 방식이 달라지기 때문이다. 코로나 바이러스 연구와 암 치료를 위한 표적항암제 개발에서 단백질 구조 정보가 중요한 역할을 한다. 2. 단백질 구조 예측의 어려움 단백질은 마구잡이로 접혀 3차원의 형태로 존재하기 때문에 그 구조를 알기가 어려웠다. 기존에는 X선을 이용한 단백질 결정 분석 방식이 유일한 방법이었지만, 비용과 시간이 많이 들어 적절한 ...2025.05.08
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식품생화학 아미노산, 펩타이드, 단백질 요약2025.05.071. 아미노산과 펩타이드 아미노산은 단백질을 이루는 기본단위 물질로서, 20개 다른 종류의 아미노산이 결합하여 펩타이드를 이루고 단백질을 형성합니다. 아미노산은 극성 아미노산(중성, 산성, 염기성)과 비극성 아미노산으로 구분되며, 중성 pH 상태에서 양극성 이온 형태로 존재합니다. 펩타이드는 아미노산이 펩타이드 결합으로 연결된 구조이며, 일부 펩타이드는 고유의 생리활성을 가지고 있습니다. 대표적인 합성 펩타이드인 아스파탐은 감미료로 사용되고 있습니다. 2. 단백질 구조 단백질은 아미노산이 중합된 고분자 물질로, 1차 구조(아미노산 ...2025.05.07
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NCBI의 유전자 서열 분석 및 단백질 삼차원 구조 모델링2025.01.231. NCBI 데이터베이스 NCBI에서 제공하는 다양한 데이터베이스(Genome, BioProject, BioSystems 등)에 대해 설명하고, 이를 통해 유전자 정보와 서열을 분석할 수 있음을 설명하였다. 2. 유전자 돌연변이 유전자 돌연변이의 개념과 종류(염기 치환, 결실, 삽입, 중복, 역위, 반복 확장 등)에 대해 설명하였다. 3. SOD1 유전자 SOD1 유전자의 기능, 발현, 관련 질병 등에 대해 자세히 설명하였다. 4. 서열 정렬 BLAST와 MSA 기법을 사용하여 SOD1 단백질 서열을 다른 생물종과 비교 분석하고,...2025.01.23
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전북대 화공 응용생화학 챕터6 과제2025.01.171. 응용병학 응용병학 6장에서는 아미노산의 구조와 성질, 아미노산의 반응, 펩타이드 결합 형성, 단백질의 구조와 기능 등에 대해 다루고 있습니다. 아미노산은 단백질을 구성하는 기본 단위이며, 펩타이드 결합을 통해 단백질이 형성됩니다. 단백질은 생명체에서 다양한 기능을 수행하는 중요한 생체 분자입니다. 2. 아미노산 아미노산은 아민기(-NH2)와 카르복실기(-COOH)를 가진 유기화합물입니다. 아미노산은 20종류의 표준 아미노산으로 구성되며, 이들이 펩타이드 결합을 통해 연결되어 단백질을 형성합니다. 아미노산의 구조와 성질에 따라 ...2025.01.17
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일반생물학실험 <단백질 검출> 예비레포트2025.01.271. 단백질 단백질은 아미노산의 펩타이드 결합으로 생긴 종합체로, 세포 내외부의 다양한 기능을 수행합니다. 단백질의 구조는 1차, 2차, 3차, 4차 구조로 이루어져 있으며, 이러한 구조에 따라 단백질의 기능이 결정됩니다. 단백질은 세포 내외부의 지지, 운동 조절, 신호 전달, 물질 수송 등의 역할을 합니다. 2. 아미노산 아미노산은 단백질의 기본 구성단위로, 카복실기와 아미노기를 포함한 분자입니다. 총 20종류의 서로 다른 아미노산이 존재하며, 이들이 펩타이드 결합을 통해 연결되어 단백질을 형성합니다. 3. 펩타이드 결합 펩타이드...2025.01.27
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아주대 생물학실험 1 생물정보학실습2025.01.121. 생물정보학 생물정보학은 생물학적 데이터를 저장, 검색, 구성하고 분석하는 데 생물공학 IT를 사용하는 분야를 일컫는다. 유전체 서열 프로젝트나 여타 연구에서 엄청난 양의 데이터가 생성되었는데, 이 데이터 웨이브의 결과 생물학 분야의 난제는 대부분 컴퓨팅 쪽 문제로 바뀌게 되었다. 생물정보학이라는 용어는 1970년 Paulien Hogeweg와 Ben Hesper가 처음 사용한 말이다. 현재는 좀 더 넓은 의미로 사용되어 컴퓨터 구조 생물학, 화학 생물학과 시스템 생물학 등을 포괄한다. 2. NCBI NCBI는 미국 국립보건원 ...2025.01.12
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생물학실험1_생물 정보학2025.05.011. 생물정보학 생물정보학은 컴퓨터를 이용하여 생물학을 연구하는 모든 분야를 포함하는 학문입니다. 생물정보학은 유전체 서열에서 유전자를 찾아내고 데이터베이스 자료와 비교하여 유사성 정도를 확인하며 유전자 산물의 구조와 기능을 예측하고 진화적인 관계를 유추하는 등 많은 일에 사용됩니다. BLAST와 같은 생물정보학 프로그램은 다양한 단백질들의 아미노산 서열이나 DNA 염기서열을 비교하는 알고리즘입니다. 이를 통해 새로운 유전자를 발견하고 유사한 유전자를 찾을 수 있습니다. 2. BLAST BLAST는 뉴클레오타이드 서열이나 아미노산 ...2025.05.01
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단백질 풀림 예비실험2025.05.091. 단백질 구조 단백질은 20종류의 아미노산이 결합하여 이루어진 고분자 화합물입니다. 단백질은 1차 구조, 2차 구조, 3차 구조, 4차 구조로 이루어져 있으며, 이러한 구조를 유지하기 위해서는 다양한 분자 내 힘과 상호작용이 필요합니다. 단백질의 구조가 변화하면 단백질의 기능도 변화하게 됩니다. 2. 단백질 풀림 단백질은 특정 구조를 유지할 때만 기능을 수행할 수 있습니다. 하지만 온도 상승, pH 변화, 극성/비극성 물질의 첨가 등 다양한 요인에 의해 단백질의 구조가 풀리게 됩니다. 단백질 풀림 여부는 닌히드린 반응, 뷰렛 반...2025.05.09