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레닌저 생화학 정리노트 Ch04. 단백질의 3차원 구조2025.05.101. 단백질의 3차원 구조 단백질의 3차원 구조는 주로 약한 상호작용에 의해 안정화되며, 4단계로 구성됩니다. 1단계는 아미노산이 공유적으로 연결되는 것이고, 2단계는 3차원 배열인 a 나선과 b 시트 형태입니다. 3단계는 단백질 사슬과 보결분자단을 포함한 모든 원자의 3차원 배열이며, 4단계는 subunits의 배열입니다. 단백질의 3차원 구조는 specific biological function을 결정하며, 이를 native fold라고 합니다. 단백질에서 다수의 호의적인 상호작용, 즉 소수성 효과, 수소 결합, London d...2025.05.10
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PAGE를 이용한 단백질의 검정2025.05.131. 단백질의 구조와 기능 단백질은 아미노산이라는 작은 구성인자의 중합체이며, 1차 구조, 2차 구조, 3차 구조, 4차 구조로 이루어져 있다. 단백질은 효소, 호르몬, 항체, 수송 단백질, 수용체 단백질, 운동 단백질, 구조 단백질 등 다양한 기능을 수행한다. 단백질은 pH, 염의 농도, 온도 등의 변화에 의해 변성될 수 있다. 2. 전기영동을 이용한 단백질 분리 전기영동은 전기적 힘을 이용하여 단백질과 같은 큰 분자들을 gel에서 이동시켜 크기에 따라 분리하는 기술이다. SDS-PAGE는 SDS와 polyacrylamide를 이...2025.05.13
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연세대학교 생화학실험(1) 6주차 Peptide Mass Fingerprinting In-gel Digestion2025.05.041. Peptide Mass Fingerprinting (PMF) Peptide Mass Fingerprinting (PMF)은 단백질 동정을 위한 기술로, 단백질을 효소로 절단하여 생성된 펩타이드의 질량을 측정하고 데이터베이스와 비교하여 단백질을 식별하는 방법입니다. 이 기술은 SDS-PAGE를 통해 분리된 단백질 밴드에서 시작되며, 밴드를 절단하고 효소로 소화하여 생성된 펩타이드의 질량을 질량분석기로 측정합니다. 이렇게 얻은 펩타이드 질량 데이터를 데이터베이스와 비교하여 단백질을 동정하게 됩니다. 2. In-gel Digesti...2025.05.04
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생화학 5단원 단백질의 정제 요약정리2025.04.301. 단백질 정제의 중요성 세포 내에서 일어나는 많은 활동들은 단백질에 의해 수행된다. 따라서 단백질이 생체 내에서 어떤 기능을 하는지 아는 것은 생명활동을 이해하는데 매우 중요하다. 단백질의 아미노산 서열은 단백질의 3차 구조를 결정하고, 이 구조가 상호작용하여 4차 구조를 만든다. 즉 폴리펩타이드의 서열이 전체 구조를 결정하고, 단백질의 고유한 구조는 단백질의 기능을 결정한다. 따라서 이들 간의 관계는 매우 중요하다. 단백질의 구조를 알고, 서열을 구하고 그 기능을 알기 위해서는 반드시 순수한 단백질이 필요하다. 따라서 단백질의...2025.04.30
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단백질의 분석(질량, 서열, ELISA) 요약정리2025.04.301. 단백질 질량 측정 단백질의 질량을 측정하기 위해서는 단백질을 기체 상태의 이온으로 바꾼 후 전기장 하에서 질량 대 전하비(m/z)를 구하는 방식을 사용한다. MALDI와 ESI 기법을 통해 단백질을 이온화할 수 있으며, 이후 TOF 분석기를 이용하여 질량을 측정할 수 있다. 2. 항체를 이용한 단백질 검출 및 정량 항체는 특정 단백질에 결합하여 면역 반응을 일으키므로, 이를 이용하여 단백질을 검출하고 정량할 수 있다. ELISA 기법은 항체와 연결된 효소를 이용하여 단백질의 존재 유무와 양을 측정할 수 있다. Western b...2025.04.30
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Peptide 질량분석2025.01.231. 펩타이드 질량분석 단백질은 20종류의 아미노산들이 여러 개 연결된 폴리펩타이드 사슬이며, 펩타이드는 둘 이상의 아미노산이 탈수축합반응을 통해 결합된 것이다. MALDI-TOF 질량분석법은 분석 물질에 자외선을 흡수하는 matrix를 넣고 레이저로 기화시켜 기체상 이온을 만들어 질량/전하수 값을 측정하는 방법이다. 실험에서는 단백질을 트립신으로 가수분해한 펩타이드 용액을 CHCA matrix와 혼합하여 MALDI-TOF 질량분석을 수행하였고, 얻어진 펩타이드 질량지문으로부터 주어진 단백질을 동정하였다. 2. MALDI-TOF 질...2025.01.23
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[생화학실험] A+, 세포파쇄 및 단백질 정량법 실험2025.01.031. 세포막 구조 동·식물(진핵세포)의 세포막은 단백질과 인지질로 구성된 이중막 구조이며, 박테리아(원핵세포)의 세포막도 이와 유사한 구조를 가지고 있다. 단백질은 온도, pH 등의 요인에 의해 구조와 기능이 변화할 수 있다. 2. 세포 파쇄 방법 세포막을 파쇄하여 세포 내 단백질 및 대사체를 안정적으로 추출하는 다양한 방법이 있다. 초음파 파쇄, 칼날 분쇄, 막자와 막자사발 분쇄, 효소 파쇄, 삼투압 파쇄, 알칼리 처리, 압착법 등이 있으며 각각의 원리와 특징이 다르다. 3. 단백질 추출 및 정량 단백질은 온도, pH 등의 요인에...2025.01.03
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닭 배아 관찰 및 단백질 분석 보고서2025.01.021. 닭 배아 발달 닭 배아의 발달 과정을 단계별로 설명하였다. 초기 세포 분열부터 시작하여 gastrulation, 신경관 및 심장 형성, 장기 발달 등 닭 배아의 발달 단계를 자세히 기술하였다. 특히 hox 유전자가 닭 배아의 신체 구조 형성에 중요한 역할을 한다는 점을 강조하였다. 2. SDS-PAGE 전기영동 SDS-PAGE 기법의 원리와 방법을 설명하였다. SDS가 단백질의 3차 구조를 1차 구조로 풀어내고 균일한 음전하를 부여하여 단백질을 크기별로 분리하는 과정을 자세히 기술하였다. 또한 전기영동 실험 과정을 단계별로 제...2025.01.02
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[A+ 보장!] 연세대 의대 의예과 1학년 General Biology 실험 레포트 Protein quantificaiton2025.01.141. 단백질 구조와 기능 단백질은 생체 내에서 다양한 기능을 수행하며, 아미노산으로 구성되어 있다. 단백질의 1차 구조는 아미노산이 펩타이드 결합으로 연결된 폴리펩타이드의 사슬이며, 2차 구조는 폴리펩타이드의 펩타이드 결합 사이의 수소 결합으로 인해 형성되는 α 나선구조와 β 병풍구조를 의미한다. 단백질의 3차 구조는 폴리펩타이드의 3차원 형태를 의미하며, 곁사슬 사이의 다양한 결합이 이를 결정한다. 마지막으로 단백질의 4차 구조는 두 개 이상의 폴리펩타이드로 구성된다. 2. Bradford assay Bradford assay는 ...2025.01.14
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일반생물학실험(1) 3주차 단백질의 검정2025.05.091. 단백질의 구조 단백질은 화학적으로 비슷한 성질을 공유하는 20가지 아미노산의 조합으로 이루어진다. 단백질의 다양성은 아미노산의 서로 다른 비율과 조합에 의해 생성된다. 단백질은 하나 이상의 폴리펩타이드사슬로 구성되며, 각각의 아미노산에는 알파 탄소 원자에 카르복실기와 아미노기가 부착되어 있다. 이때 카르복실기의 C=O는 약한 음전하를, 아미노기의 N-H는 약한 양전하를 띠는데, 이 비대칭에 의해 수소결합이 이루어지고, 이 결합은 단백질의 기능과 구조를 다양하게 한다. 또한 아미노산에는 단백질의 기능과 3차원 구조를 결정하는 곁...2025.05.09
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