Sanger sequencing

목차

1.서론(INTRODUCTION)
2.목적(PURPOSE)
3.재료 및 방법(MATERIALS & METHODS)
4.결과(RESULTS)
5.고찰(DISCUSSION)

본문내용

서론(INTRODUCTION)
DNA 기반 방법(DNA based methods)은 그 발생에 대한 통찰력을 제공하지만, 상대적 풍요와 생태학적 틈새, 리보솜, 유전자와 표지, 특히 소단위(SSU)는 원핵생물에서 바코드 표적으로 (증폭의 용이성, 범용 프라이머(Primer)의 존재 위치 및 도메인에 걸친 정렬 가능성)널리 사용된다. (Coleet al, 2009)
희귀 변종이 복합 질환의 병인에 기여한다는 증거가 늘어나고 있다. 일반 희귀 품종과 희귀 품종에 대한 교차비 (OR) 분포의 현저한 차이는 다양한 희귀 변종에 대한 더 높은 OR을 선호한다. 물론, 복잡한 특성과 연관된 코딩 드문 변형 때때로 아미노산 치환을 통해 인과 것을 증명되었다. 이러한 이유 때문에 희귀 변종은 일반적인 염기쌍 변이에 의해 설명되지 않는 유전성의 원천으로서의 약속을 지니고 있다. 질병과 관련된 희귀 변종을 확인하는 데에는 그러한 다형성이 거의 없기 때문에 표본 크기가 커야한다. 또한, 희귀 변종의 경우 GWAS (genome-wide association study)와 같은 단일 마커 검사의 힘이 약하다. 따라서 대체 방법의 개발이 필수적이다. 지난 2 년 동안 점점 더 많은 수의 방법들 이러한 한계를 극복하고자 노력했다. 이러한 방법은 일반적으로 영역 전체의 마커 접기, 마커의 가중치 및 / 또는 우선 순위 지정 및 분포 기반 방식의 세 가지 기본 전략을 사용한다.

참고 자료

희귀 변종 연계 방법의 경험적 힘: 1,998명의 개체에서 Sanger sequencing 결과 (Martin Ladouceur, https://doi.org/10.1371/journal.pgen.1002496 ,2012)
http://genetics.bwh.harvard.edu/rare_variants
열대성 균근균의 파이로 시퀀싱(Pyrosequencing)과 생거(Sanger)염기서열 분석은 유사한 결과를 제공하지만 실질적인 방법론적 편향 (L Tedersoo, 2010, Wiley Online Library)
생명과학대사전
[위키피디아] 막심 - 긻트 시퀀싱
[위키피디아] 생거 시퀀싱
NGS (Next Generation DNA sequencer)의 원리와 그 응용 서울대학교 최인영