RNA transcripts isolation and Reverse transcription from mouse tissue(마우스 조직에서 RNA 분리와 역전사) 실험보고서

소개글

mouse의 서로 다른 조직에서 cell을 분리하고 이들 cell이 포함하고 있는 RNA transcript를 뽑아 몇 가지 gene에 대한 발현 차이를 비교함으로서 각 세포들이 발현하는 유전자와 그 양이 세포의 특성과 어떠한 연관성을 가지고 있는지 고찰하는 것을 목적으로 한 실험보고서 (실험과정은 생략하였으니 참고하세요)

목차

Ⅰ. Introduction
Ⅱ. Result
Ⅱ.1 PPARg
Ⅱ.2 Adiponectin
Ⅱ.3 ADD1
Ⅲ. Discussion
Ⅳ. Reference

본문내용

[RNA transcripts isolation and Reverse transcription from mouse tissue]
Ⅰ. Introduction
다세포 생물에서 세포들 간의 기능적, 구조적 차이는 각 세포에서의 유전자 발현 차이로부터 기인한다. 본 실험에서는 mouse의 서로 다른 조직에서 cell을 분리하고 이들 cell이 포함하고 있는 RNA transcript를 뽑아 몇 가지 gene에 대한 발현 차이를 비교함으로서 각 세포들이 발현하는 유전자와 그 양이 세포의 특성과 어떠한 연관성을 가지고 있는지 고찰하고자 한다. 본 실험에서는 쥐의 Fat, liver, heart cell을 사용하고, cyclophilin을 보정gene으로 하여 PPARg, Adiponectin, ADD1의 발현량을 비교할 뿐 아니라, gene의 기능을 토대로 하여 PEPCK의 발현 양상을 추측하였다.
Ⅱ. Result
Ⅱ.1 PPARg
지방 세포를 기준으로 하여 liver와 heart cell의 PPARg의 발현량을 비교해 본 결과 Fat에서의 상대량을 1로 뒀을 때 liver는 약 0.24, heart는 약 0.89 만큼의 PPARg를 발현한 것으로 나타났다. 따라서 PPARg의 발현량은 fat> heart> liver 순이다.
Ⅱ.2 Adiponectin
Fat에서의 Adiponectin 발현량의 상대값을 1로 두면 liver와 heart에서의 발현량은 각각 0.0009, 0.0023 정도로 그래프 상에 표현되지 않을 만큼 작은 값이 관측되었다. 즉 adiponectin은 fat에서 specific하게 발현된다는 사실을 알 수 있다.
Ⅱ.3 ADD1
ADD1의 경우 발현량의 상대값이 fat, liver, heart 순서로 1, 0.21, 0.27로 관측되었다. 이는 Fat에서 특히 많이 발현되며 liver와 heart에서는 거의 유사한 수준으로 발현되고 있음을 의미한다.
[그림1] PPARg, Adiponectin, ADD1의 transcriptio

참고 자료

- Gomez-Valades AG et. al. <> (Abstract 참고)
- Hui X, Lam KS, Vanhoutte PM, Xu A. <> (Abstract 부분만 간접 인용)
- Kursawe R et. al., <> Obesity (Silver Spring). 2010 Oct;18(10):1911-7.
- Yamamoto Y et. al., <>, , 2008.
- Sun Q, Tang M, Yu J. <> , 2011 Apr 10.
- Michael Carey, Stephen T. Smale, <>, CSHL press, (2001) p.p 71-86