NCBI-bioinformatics
- 최초 등록일
- 2003.09.22
- 최종 저작일
- 2003.09
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목차
1. NCBI genbank database에서 찾은 sequence에 대한 검색 결과분석
2. Open Reading Frame 분석
3. 제한효소 활성부위 분석
4. 참 고
본문내용
1. NCBI genbank database에서 찾은 sequence에 대한 검색 결과분석
(1) 정의
bHLH 전사 인자를 합성할 수 있는 1147bp 의 Arabidopsis thaliana (애기장대) mRNA이다.
(2) Source 생물체 - Arabidopsis thaliana (애기장대)
십자화과의 일년생 초본식물로 10여년전부터 식물학의 많은 분야에서 복잡한 생물현상을 연구하기 위한 많은 장점을 갖고 있는 model plant로 이용되고 있다. 이 식물은 쌍자엽 식물로써 다른 식물과는 비교가 되지 않을 정도의 빠른 생활사를 가지며(6-8주), 그 크기가 작아서 좁은 공간의 실내에서나 멸균된 배양 배지에서도 배양이 가능하다. 뿐만 아니라 이 식물은 자가 수분을 하고 한 개체의 식물로부터 많은 씨를 생산하고(10,000 seeds per plant), 고등식물 중에서 가장 작은 genome을 가지며(70 Mb/haploid nucleus), 반복적인 염기 서열이 적어 유전자 분석과 형질전환이 용이하다.
참고 자료
Web Site - "http://genes.mit.edu/GENSCAN.html" ,
"http://us.expasy.org/prosite" ,
NCBI homepage , 제한효소 검색 사이트.