Bioinformatics

소개글

DNA sequencing 관련된 실험 보고서입니다.

목차

◎실험 목적

◎실험 방법

◎실험 결과 및 논의

Reference

본문내용

◎실험 목적
; DNA 서열을 분석하는 방법의 발달에 따라 현재 수많은 종의 게놈 서열이 밝혀져 있으며, 이로부터 만들어지는 단백질이나 RNA 서열 정보 또한 많은 수로 늘어나고 있다. 또한, 특정 조건에서의 유전자들의 발현량, 그들의 산물 및 상호작용들에 대한 정보가 Transcriptomics, Proteomics, Metabolomics와 같은 방법들을 이용하여 대규모로 얻어지고 있다. 이와 같이 데이터의 양이 급격히 증가함에 따라 이를 수작업으로 다룬다는 것은 불가능하게 되었으며, 이로부터 유용한 지식을 얻어내기 위해서는 수학, 통계학, 전산학을 기반으로 하는 방법론들이 필요로 하게 되었다. 이처럼 생물체로부터 얻어진 대량의 데이터로부터 유용한 지식을 얻어내기 위한 전산/통계/수학적인 도구를 통칭하여 생물정보학(Bioinformatics)이라고 한다. 이번 실험에서는 Bioinformatics 연구 활동 중 DNA sequencing에 대해 알아보고 인터넷 사이트를 이용해 sample에 대한 여러 가지 정보를 알아보았다.

◎실험 방법
1. Sample sequence 하나를 선택하여 nucleotide blast를 한 뒤 어떤 유전자인지 결과를 분석하였다.
2. 해당 유전자가 생성하는 단백질을 protein blast로 찾았다.
3. Protein이 가진 conserved domain을 찾아서 구조를 확인하였다.
4. 다른 생물체에 homolog가 있는지 확인하였다
5. DNA sequence의 Restriction Enzyme site를 찾아보았다

참고 자료

1) http://tools.neb.com/NEBcutter2/index.php
2) http://www.ncbi.nlm.nih.gov/