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분자생물생화학실험(대장균 갈락토오스 오페론프로모터 위치탐색)

*영*
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2021.02.25
최종 저작일
2015.04
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소개글

"분자생물생화학실험(대장균 갈락토오스 오페론프로모터 위치탐색)"에 대한 내용입니다.

목차

Ⅰ. Introduction
Ⅱ. Materials and Methods
Ⅲ. Results
Ⅳ. Discussion
Ⅴ. References

본문내용

Operon이란 chromosome 상에 promoter와 operator와 같은 조절부위와 구조 유전자(암호화 부위)가 인접하여 늘어서 있는 부분으로, 조절 유전자에 의해 한 번에 제어를 받는 전사 단위를 말한다(Reece et al., 2012).
Promoter는 RNA polymerase가 1차적으로 결합하는 DNA 서열을 말하며 promoter와 RNA polymerase의 복합체가 형성되면 transcription을 개시하기 위해 구조 변화가 일어난다(Watson et al., 2013).
Promoter에서 일어나는 복제 과정을 알아보면, DNA복제개시처럼 전사 개시점 주변의 DNA가 풀린 뒤 염기쌍이 분리되어 single DNA로 된 transcription bubble 형태가 된다. 또한 DNA 복제처럼 전사는 항상 5‘에서 3’ 방향으로 진행한다. 즉, 신장되는 가닥의 3’ 말단에 새 ribonucleotides가 첨가된다. 그러나 DNA 복제와는 달리 DNA 가닥 중 단 한 개의 가닥만이 한 개의 RNA 가닥 합성의 template으로 사용된다. RNA 중합효소는 promoter에 특정한 방향으로만 결합하기 때문에 그 promoter에서 전사되는 가닥은 항상 같다. 이러한 promoter에는 TATA box, CAAT box등의 특정한 염기서열이 존재하는데 이러한 염기서열이 있기 때문에 RNA polymerase가 특정 장소에 결합하거나 정확한 위치에서 전사를 할 수 있게 된다.
대장균에서 RNA polymerase에 의해 인지되는 특정한 염기서열은 공통적으로 6개의 nucleotides로 구성된 2개의 잘 보존된 염기서열이며, 이 둘 사이에는 비 특이적인 17~19개의 nucleotides sequences가 존재하며 분리한다. 두개의 특정 sequences의 중앙은 RNA 합성의 개시점으로부터 상류로 약 10 염기쌍과 35 염기쌍 부위에 위치한다. 이러한 서열을 –35 region과 –10 region또는 element라고 한다.

참고 자료

안정선, 안태인, 이동희, 이병재, 이주헌, 정학성, 허윤강. 2006. 분자생물학 유전혁명의 이해. 월드사이언스. pp. 426-428.
Bansal P., Chakrabarti K., Gupta S.K. 2009. Functional activity of human ZP3 primary sperm receptor resides toward its C-terminus. Biol. Reprod. 81 (1): 7–15.
Behrends U., Jandl T., Golbeck A., et al. 2002. Novel products of the HUD, HUC, NNP-1 and alpha-internexin genes identified by autologous antibody screening of a pediatric neuroblastoma library. Int. J. Cancer 100 (6): 669–77.
Coligan John E., Barbara E. Bierer, David H. Margulies, Ethan M. Shevach and Warren Strober. 2005. Short Protocols In Immunology. John Wiley & Sons Inc. pp. 9-34.
Heon Man Lim, Hee Jung Lee, Siddhartha Roy, and Sankar Adhya. 2001. A “'master”' in base unpairing during isomerization of a promoter upon RNA polymerase binding. PNAS. pp 1-4
Hee Jung Lee, Heon Man Lim, and Sankar Adhya. 2004. An Unsubstituted C2 Hydrogen of Adenine Is Critical and Sufficient at the -11 Position of a Promoter to Signal Base Pair Deformation. JBC. pp 1-5
Joseph Sambrook and David W. Russel. 2001. Molecular Cloning: A Laboratory Manual (3rd ed.). Cold Spring Harbor, N.Y.: Cold Spring Harbor Laboratory Press. ISBN 0-879-69576-5. Chapter 8: In vitro Amplification of DNA by the Polymerase Chain Reaction.
Joshi A.K., Baichwal, V. and Ames, G.F. 1991. Rapid polymerase chain reaction using intact bacterial cells. Biotechniques. 10: 4244-4245.
Kammann M., Laufs J., Schell J. and Gronenborn B. 1989. Nucleic Acids Res. 17, 5404.
Reece, J. B., L. A. Urry., M. L. Cain., S. A. Wasserman., P. V. Minorsky., and R. B. Jackson. 2012. 캠벨 생명과학. 9th Ed., 바이오사이언스, p352-353
Rendina, George. 1976. Experimental Methods in Modern Biochemistry. W. B. Saunders Company: Philadelphia, PA. pp. 46-55.
Song-Hua Ke and Edwin L. Madison. 1997. Rapid and efficient site-directed mutagenesis by single-tube ‘megaprimer’ PCR method. Nucleic Acids Res. 25(16): 3371–3372.
Watson, James. D., A. Baker. Tania, P. Bell. Stephen, Gann. Alexander, Levine. Michael, and Losick. Richard. 2013. Molecular Biology of the Gene. 7th Ed., PEARSON, pp432-435
http://www.addgene.org/vector-database/3334/

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