생물정보학 보고서

목차

1. 실험 제목
2. 실험 목적
3. 실험 결과
4. 고찰
5. 참고문헌

본문내용

이번 실험은 생물정보학 학문을 이해하고 생물정보학 Tool을 사용하여 미지의 유전자를 데이터베이스에 대조하고 어떤 서열인지 탐구하고, 단백질 서열의 서열 유사성을 비교해보는 시간을 가졌다.
“서열 데이터 베이스에 대한 BLAST 검색은 수십 혹은 수백 개의 후보 정렬을 내놓는데, 이들 정렬 결과로부터 어떤 것이 정말 중요한 상보성을 가진 것이고 어떤 것이 관련 없는 것인지는 E-Value로 판단할 수 있다. BLAST의 E-Value가 0에 가까울 수록 쿼리서열이 우연히 조합되어 만들어졌을 가능성이 매우 작다. 즉 랜덤 서열 중 비슷한 게 거의 없다는 의미를 가져 어떤 정보를 담고 있을 확률이 높다는 뜻이 되며, E-Value 값이 작을 수록 이 값의 신뢰도가 높게 된다.” 1)
먼저 BLAST 실습 중 1번 서열은 값이 여러 개 나왔는데 E-Value 값이 제일 낮은 9e-19의 결과를 이용해 검색해 본 결과 오리너구리로 추정된다.

참고 자료

1) 김무상, “NCBI의 소개 (II) BLAST”, p.10
NCBI-BLAST.pdf