NGS를 이용한 돼지장내미생물 분석 논문형식 (캡스톤 A+받은자료)

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목차

I. 서론

II. 연구 방법
1. 실험대상
2. DNA 추출
3. 16S rRNA 유전자의 RCP 증폭 및 Illumina MiSeq 분석
4. Bioinformatic analysis

III. 결과
1. Genomic DNA 농도
2. Genomic DNA 전기영동
3. Alpha analysis
4. 장내 미생물 군집
4.1. 미생물 분포도
4.2. butyrate-producing bacteria
4.3. Potential pathogen bacteria
4.4. Lactic acid bacteria
4.5. Other probiotic bacteria

II. 고찰

IV. 활용방안 및 기대효과

본문내용

인간과 동물들의 기관과 조직에는 함께 살아온 미생물들이 있다. 특히 소화관 점막에는 가장 많은 미생물이 존재하고 이를 장내 미생물 군집(gut microbiota)이라고 한다. 장내 미생물은 동물의 건강에 있어서 중요한 역할과 유전적 다양성을 가지고 있다.
최근에는 비만에서 장내 미생물이 중요한 역할을 하는 것으로 알려져 있고 특히 Firmicutes 및 Bacteroidetes의 상대적 비율이 에너지 항상성에서 중요한 것으로 보인다. 그러나 건강한 미생물 군집의 기능은 아직 질적으로, 양적으로 정의되어 있지 않아 동물의 건강을 위한 연구가 진행되고 있다.
혐기성 장내 미생물에 의한 식이섬유 발효의 최종 산물인 SCFA (short-chain fatty acid)는 포유류 에너지 대사에 여러 가지 유익한 효과를 발휘하는 것으로 알려져 있다. 특히 장내 장벽 기능, 포도당 항상성, 면역 조절, 식욕 조절 및 비만과 관련된 다양한 조직 특이적 작용을 통해 숙주 건강을 직접 조절한다. 일반적으로 장내의 SCFA는 acetate：propionate：butyrate의 분자량적 비율(molar proportion)이 3：1：1을 이루고 있다. 이들은 장 상피 장벽 기능을 촉진하고 숙주 점막 면역 시스템을 조절한다.
butyrate를 생성할 수 있는 미생물은 주로 그람 양성 혐기성 미생물 중 널리 분포되어 있고 Faecalibacterium prausnitzii와 Roseburia spp 등이 있다. Firmicutes인 F. prausnitzii와 E. rectale는 건강한 장내 미생물 군집에서 가장 많은 숫자로 나타난다. 이 균들은 서로 다른 생태학적 환경을 갖는다. 이와 같이 균에 따라 생태계가 다른 이유는 장내 환경이 변화하더라도 butyrate 생성이라는 중요한 대사 과정이 일정하게 유지할 수 있도록 진화된 결과라고 추정된다.

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