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질환 연구에 있어 전사체학 transcriptomics 의 활용

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최초 등록일
2021.03.11
최종 저작일
2020.11
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"질환 연구에 있어 전사체학 transcriptomics 의 활용"에 대한 내용입니다.

목차

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본문내용

전사체 수준에서의 질병에 대한 연구는 DNA 마이크로어레이(microarray)등의 다양한 방식으로 전사체의 처리량 증가와 분석 기술의 발달을 거듭하고 있다. 단백질 활성의 직접 정량보다 분석이 쉽고, 간접적 지표로서의 가치가 있다. 하지만 환경의 변화에 민감한 RNA는 다루기가 어렵다. RNA로 질병의 진단과 치료, 그리고 예후에 적용하는 사례에는 RNA의 종류별로 어떤 것 들이 있을 지 각각의 논문들을 통해 알아보도록 하자.

기존의 분자 생물학적 방법과 같이 한 번에 유전자 하나에 대한 접근을 시도하고 이로부터 획득한 데이터들을 수집해서 전체적인 의미를 도출하는 형태의 방법은 대량의 데이터를 포함하는 종합적인 분석에 적합하지 않다. 분자 생물학과 공학 기술을 결합하여 고안된 DNA microarray 기술은 동시에 대량의 유전자에 대해 특정 조건에 따른 발현 정보를 관찰할 수 있게 해 줌으로써 이러한 분야에서의 효과적인 분석을 가능하게 하고 있다.

참고 자료

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신기원, 정규열. 전사체학(Transcriptomics)에 있어서의 황금표준정량법(Gold Standard Method). 유전체 소식, Korea Genome Organization. www.kogo.or.kr
Small RNA sequencing profiles of mir-181 and mir-221, the most relevant microRNAs in acute myeloid leukemia( Yun-gyoo Lee ) , ( Inho Kim ) , ( Somi Oh ) , ( Dong-yeop Shin ) , ( Youngil Koh ) , ( Keun-wook Lee ). 2019. Small RNA sequencing profiles of mir-181 and mir-221, the most relevant microRNAs in acute myeloid leukemia. The Korean Journal of Internal Medicine, 34(1) : 178-183
Mi-Na Kim. (2016). Analytical and Clinical Validation of Six Commercial Middle East Respiratory Syndrome Coronavirus RNA Detection Kits Based on Real-Time Reverse-Transcription PCR. , 36(5), 450-456.
RNA-seq 분석을 통한 폐섬유화 복합 AOP 고도화(Developing tentative AOP network for lung fibrosis using RNA-sequencing) 이상우1 · 송미경2,3· 이규홍2,3· 윤석주1,3 · 김우근1,3* 예측독성연구본부, 안전성평가연구소1 호흡기질환제품 유효성평가연구단, 안전성평가연구소2 인체 및 환경 독성학, 과학기술연합대학원대학교3
*Corresponding author: wookkim@kitox.re.kr
Tongtawee, Taweesak, Dechsukhum, Chavaboon, Leeanansaksiri, Wilairat, Kaewpitoon, Soraya, Kaewpitoon, Natthawut, Loyd, Ryan A, Matrakool, Likit, Panpimanmas, Sukij. (2015). Genetic Polymorphism of MDM2 SNP309 in Patients with Helicobacter Pylori-Associated Gastritis. , 16(16), 7049-7052.
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그림출처: https://www.youtube.com/watch?v=6ZzFihESjp0(DNA마이크로 어레이)
https://www.youtube.com/watch?v=6wJ9he9tkuQ
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