바이러스의 생존 전략

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1. Polyprotein : 한 개의 protein 덩어리를 길게 만든 후 자름, 기능 단위로 스스로 자를 수 있는 domain의 작용으로 자름 (포티 바이러스에서 많이 볼 수 있는 전략)
-cis : 원래의 구조에서 자르는 것 / trans : 독립적으로 다시 자르는 것
2. Subgenomic RNAs : 바이러스 복제 시 ORF가 한 개 이상일 때 작은 RNA을 만드는 것
서로 다른 subgenomic RNA는 5’이 다르고 3’이 같음
3. Multipartite genomes : 바이러스 감염을 위한 cycle 정보를 2개 또는 그 이상의 핵산 조각으로 나누어 가짐
4. Splicing : 일반 식물 바이러스와 다르게 Caulimoviridae 와 Geminiviridae 는 인트론을 갖기 때문에 인트론을 제거하는 과정이 필요함
5. Ambisense : (+)가닥 뿐만아니라 상보적인 (-)가닥도 변역되는경우
6. Internal initiation : 원래 cap잇어야 하는데 2차 구조로 꼬인가닥과 식물유래단백질의 상호작용이 cap을 대신하는 경우
7. Leaky scanning : 처음 start codon을 인식하지 못하고 약간 틀어진 상태로 codon을 인식함
8. Translational shunt : 복잡한 cap구조를 jump해 버리는 경우
9. Non-AUG start codon : 약 10%정도 UAA를 start codon으로 인지해서 단백질을 형성하기도 하지만 이는 낮은 효율성을 보임
10. Transactivation : 리보솜이 못 떨어져서 변역이 계속 이루어짐, short ORF의 단백질이 RNA 번역을 도움
11. Read-through proteins : stop codon을 인식하지 못하거나 일부러 건너 뛰어 codon을 인식함, Tyr이 관여함 ( UAA>UAG>UGA )
12. Frame shift proteins : codon을 인식하다가 back을 해서 인식하는 codon frame이 달라져 완전히 다른 아미노산을 형성함

참고 자료

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