DNA-binding domain 모티프

소개글

DNA 결합 도메인

목차

1. DNA-binding domain
2. Transcription-activation domain

본문내용

DNA에 결합하는 단백질들에서 볼 수 있는 공통적인 특징은 major groove에 맞는 α-나선 부분이 있다는 것이다. major groove와 α-나선의 길이가 비슷하기 때문에 들어맞을 수 있다. 이 α-나선은 가장 흔한 모티프인데, 이유는 표준형 B-DNA가 이에 맞는 크기를 가지고 있어 구조변화가 필요하지 않기 때문이다.
HTH 모티프는 많은 다른 DNA-binding 단백질 내에 있는 20개의 아미노산 서열이다. 첫 번째 나선 지역은 처음 오는 아미노산 8개로 이루어져 있다. 이 지역과 두 번째 나선 지역 사이에는 아미노산 3~4개로 된 서열이 있어서 두 나선이 분리되어 있다. 9번 위치에 있는 글라이신은 β-turn에 관여되어있다. 나선구조의 변화는 A-T가 풍부한 지역이 있을 때 발생한다. 염기들은 거의 프로펠러 형으로 꼬인다. 많은 단백질들이 minor groove 쪽으로 나온 염기들의 가장자리와 결합한다.

참고 자료

없음