중앙대학교 SNP sequence분석 결과레포트
- 최초 등록일
- 2021.12.15
- 최종 저작일
- 2021.09
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목차
1. Subject
2. Object
3. Introduction
4. Methods
5. Result
6. Discussion
7. Reference
본문내용
1. Subject: SNP sequence 분석
2. Object: PPAR-gamma gene의 역할을 알아보고, PPAR-gamma gene에서 확인하고자 하는 SNP가 있는 특정 site를 증폭하고 이를 Hga1제한효소로 잘라 PCR로 증폭한 크기를 band를 통해 보고 SNP가 있는지, 또 homozygous인지 heterozygous인지 추론해본다.
3. Introduction
(1) 제한효소 (restriction enzyme)
① 세포내로 침입해 들어오는 외부의 DNA를 절단하는 효소
② DNA 분자내의 특정한 염기서열을 인식하고 특정 부위를 절단함
③ 특성에 따라 Ⅰ, Ⅱ, Ⅲ형으로 나뉨
(2) Restriction fragment length polymorphism
① DNA를 제한효소로 절단하였을 때, 절단된 유전자의 길이가 개인에 따라 다양하게 나타나는
현상
② SNP site를 인식하는 제한효소를 이용하여 SNP type을 결정
Ex) SNP: Pro12Ala => GACGCA : recessive or GACCCA : dominant
Restriction Enzyme: Hga1 => GACGC를 인식
PCR product size: 296bp
SNP site 위치: 224번째 bp
참고 자료
https://www.ksmcb.or.kr/file/webzine/2014_02_01.pdf
https://synapse.koreamed.org/upload/SynapseData/PDFData/0004kdj/kdj-32-399.pdf
http://atlasgeneticsoncology.org/Genes/GC_PPARG.html
http://www.foodsafetykorea.go.kr/foodcode/01_03.jsp?idx=778
https://www.qiagen.com/us/resources/faq?id=276f9726-5e0c-4941-a394-45cf2c2b8fdd&lang=en
