서울대학교 일반화학실험 : MALDI-TOF 펩타이드 질량분석 (말디토프)

소개글

서울대학교 일반화학실험 수업에서 실시한 말디토프(MALDI-TOF) 펩타이드 질량분석 실험에 대한 보고서입니다.

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본문내용

Lysozyme
K_VFGR_CELAAAMK_R_HGLDNYR_GYSLGNWVCAAK_FESNFNTQATNR_NTDGSTDYGILQINSR_WWCNDGR_TPGSR_NLCNIPCSALLSSDITASVNCAK_K_IVSDGNGMNAWVAWR_NR_CK_GTDVQAWIR_GCR_L

Hemoglobin
subunit alpha
MVLSAADK_GNVK_AAWGK_VGGHAAEYGAEALER_MFLSFPTTK_TYFPHFDLSHGSAQVK_GHGAK_VAAALTK_AVEHLDDLPGALSELSDLHAHK_LR_VDPVNFK_LLSHSLLVTLASHLPSDFTPAVHASLDK_FLANVSTVLTSK_YR

Hemoglobin
subunit beta
MLTAEEK_AAVTAFWGK_VK_VDEVGGEALGR_LLVVYPWTQR_FFESFGDLSTADAVMNNPK_VK_AHGK_K_VLDSFSNGMK_HLDDLK_GTFAALSELHCDK_LHVDPENFK_LLGNVLVVVLAR_NFGK_EFTPVLQADFQK_VVAGVANALAHR_YH

< 중 략 >

기본 과제
1. 인터넷에 올려져 있는 단백질들의 아미노산 서열을 이용해서 이론적으로 트립신 처리를 했을 때 생기는 펩타이드의 분자량을 구하여라. 단, 트립신 처리된 펩타이드의 아미노산의 갯수가 5~20개인 것을 골라서 계산한다. 먼저 부록을 출력한 다음 잘라지는 부분을 표시한 후 리포트에 정리하는 것이 진행할 때 편할 것이다.

2. 위에서 만든 데이터를 바탕으로 해서 본인의(예시) 스펙트럼 결과를 고찰해 보았을 때, 어떤 단백질인지, 그리고 질량 분석 결과 나온 데이터는 그 단백질의 어느 부분인지 표시하시오.

3. 결과 중에서 잘 맞지 않는 부분은 왜 그런 것일까? 트립신이 잘못 잘라서 놓쳤을 경우를 고려해서 나오지 않은 펩타이드는 어느 부분인지 확인해 본다.
(트립신이 K나 R을 전부 다 자르지 못할 수도 있다. 2에서 찾은 단백질만을 가지고 다시 조사하도록 한다.)

참고 자료

없음