[유전학레포트]genotyping 1

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유전자를 knocking out하는 것은 살아있는 organism의 기능에 장애를 입히는 것을 의미한다. 이 'knockout'된 organism의 phenotypic한 효과를 관찰하면, 장애를 입게된 유전자가 어떠한 기능을 하는지 유추할 수 있다.
이때 유전자를 knockout하는 기술로서 여러 가지 방법 중 Cre/loxP system을 이용하는 방법이 있다. loxP는 ATAACTTCGTATA -NNNTANNN- TATACGAAGTTAT로 34bp를 갖으며, NNNTANNN을 기준으로 좌우가 서로 상보적인 염기서열을 이루는 유전자이다. Cre recombinase가 이 loxP site와 orientation, location을 인지하여 rearrange한다. 이때 세 가지 양상으로 작용될 수 있으며, loxP site 사이의 gene이 뒤집히는 inversion, 삭제되는 deletion, 위치가 바뀌는 Translocation이 그것이다.

참고 자료

Creating a Knockout Mouse, MIAMI, http://www.bio.miami.edu/dana/dox/knockout.html
Pauline Nicole de la Pena, How does Cre-Lox recombination work?, Quora, https://www.quora.com/How-does-Cre-Lox-recombination-work
Cre-lox Plasmids, addgene, https://www.addgene.org/cre-lox/#lox.
Manual_AccuPower® Taq PCR Master Mix, Bioneer.
Taq 중합효소, 분자·세포생물학백과. https://terms.naver.com/list.nhn?cid=61233&categoryId=61233
더무스 아쿠아티쿠스, 미생물학백과, https://terms.naver.com/entry.nhn?docId=5703283&cid=61232&categoryId=61232

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