18S rRNA Sequence를 이용한 계통 추적 - 동물비교해부학

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본문내용

16S와 18S의 기능적으로 유사한 역할을 합니다만 기본적으로 RNA 2차구조가 다릅니다. 크게 원핵세포(prokaryore)인 세균(Bacteria), 고세균(Archaea)와 진핵세포 (Eukaryote) 세가지로 나눠 볼 수 있는데 이들의 2차구조는 세 가지가 서로 다릅니다. 물론 세균과 고세균은 진핵세포의 rRNA에 비해 상대적으로 유사합니다만 각각 세균은 세균대로 고세균은 고세균대로 stem-loop로 만들어지는 2차구조가 서로 다른 종사이에서 매우 잘 보존되어 있습니다. 이 2차구조는 1차구조보다 더 잘 보존되어 있는 것이 특징이며 이것은 rRNA가 기능에서 유래하는 것으로 보여지고 있습니다.

<중략>

prokaryote의 16s rRNA에는 Shine-Dalgarno(SD) sequence가 존재하여 이부위가 mRNA와 결합하여 translation 시작 eukaryote의 18s rRNA에는 SD sequence가 없으므로 40s ribosome은 mRNA의 5'cap부위에 결합후 AUG codon을 만날때까지 mRNA를 scan하면서 내려가게되는데 이과정에서 ATP가 필요합니다. 5s rRNA의 차이는 속한 ribosome subunit의 크기가 다르다라는 결론.

참고 자료

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