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DNA cloning of the T4 DNA ligase gene and expression of the protein n in E. Coli

*연*
최초 등록일
2013.08.07
최종 저작일
2012.03
12페이지/워드파일 MS 워드
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목차

1. Introduction
2. Materials
3. Experimental Procedure
4. Results & Discussion
5. Conclusion & Opinion
6. Reference

본문내용

Gene cloning은 세포 내 특정 DNA sequence를 분리하고 이를 복제하여 여러 개의 copy를 얻는 과정이다. 본 실험에서는 bacteriophage T4 DNA ligase protein을 얻기 위하여 E.coli를 이용하여 T4 DNA ligase gene(크기 1464base)를 cloning하였다. 더불어 T4 ligase를 발현, 효소의 활성을 측정하였다. DNA ligase는 특별한 타입의 ligase로써 DNA 복제 및 수복 때 2중 나선 중 한쪽 사슬의 절단부인 3`-hydroxyl end와 5`-phosphate end를 covalnet phosphodiester bond로 결합시키는 효소이다.
Bacteriophage T4 DNA ligase는 Bacteriophage T4로부터 추출된 DNA ligase로써, 68kDa의 single polypeptide (pI = 6.0–6.2)이다. 이는 3’-OH와 5’-phosphate termini를 가진 DNA molecule의 연결 반응을 촉매하며, DNA, RNA, DNA-RNA hyprid duplex의 blunt end와 sticky end, nick을 모두 연결한다. 이는 dsDNA end간의 연결뿐만 아니라, dsDNA내의 single-strand nick을 repair하는 반응도 촉매 한다. pH 7.5~8.0에서 최대 활성을 보여주며, 활성을 위해 ATP와 Mg2+ (10mM에서 최대활성)가 필요하다. Sulfhydryl reagent(DTT, 2-mercaptoethanol) 또한 요구되며, 200mM이상의 NaCl에 의해 활성이 떨어진다. DNA ligation은 Molecular biology에서 다양하게 쓰이는 반응으로 특히 blunt end ligation 반응 촉매 능력이 우월한 T4 DNA ligase는 실험실에서 많이 쓰이는 효소 중 하나이다. 따라서 이러한 T4 DNA ligase를 cloning 하여 expression할 수 있다면 매우 실용적일 것이며 이 실험은 gene cloning 과정에 의해 생산된 T4 DNA ligase의 enzyme activity를 측정함으로써, 이러한 실용성을 검증하는 것을 목표로 했다.

참고 자료

MURRAY, N., BRUCE, S., AND MURRAY, K.: MOLECULAR CLONING OF DNA LIGASE GENE FROM BACTERIOPHAGE T4. JOURN. MOLEC. BIOL., 132, 493 (1979).
WEISS, B., JACQUEMINSABLON, A., LIVE, T., FAREED, G., AND RICHARDSON, C.: ENZYMATIC BREAKAGE AND JOINING OF DEOXYRIBONUCLEIC ACID. VI FURTHER PURIFICATION AND PROPERTIES OF POLYNUCLETOIDE LIGASE FROM ESCHERICHIA COLI INFECTED WITH BACTERIOPHAGE T4. J. BIOL. CHEM., 243, 4543 (1968).
ROSSI, R., MONTECUCCO, A., CIARROCCHI, G., AND BIAMONTI, G.: FUNCTIONAL CHARACTERIZATION OF THE T4 DNA LIGASE: A NEW INSIGHT INTO THE MECHANISM OF ACTION , NUCLEIC ACIDS RES 25, 2106, 1997
BLABER M. 1998 SPRING. WEB PAGE FOR LECTURE 25 OF MOLECULAR BIOLOGY AND BIOTECHNOLOGY COURSE: PROKARYOTIC EXPRESSION VECTORS. ACCESSED 2003 FEB17.
UNGER TF. 1997. SHOW ME THE MONEY: PROKARYOTIC EXPRESSION VECTORS AND PURIFICATION SYSTEMS. THE SCIENTIST 11(17). ACCESSED 2003 FEB 17
http://www.fermentas.com/catalog/modifyingenzymes/t4dnaligase.htm
Modern Experimental Biochemistry 3rd edition, Rodney Boyer, Benjamin Commings, page 43, 44
http://genehunters.co.kr/Training/0122.htm, 유전단백체 기능제어 연구센터, 2005
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