ROR alpha (대장암 억제 유전자)의 NCBI를 통한 분석자료

소개글

ROR alpha - 대장암억제 유전자의 억제 효과를 신문기사를 통해 접한 후
이에 대한 활성 근거와 genomic DNA cDNA에 대한 자료 분석이다.

목차

1.신문기사
2.genomic DNA
3.cDNA
4. activity 근거

본문내용

RORalpha는 기존 소뇌의 기능장애를 유발하는 인자로 알려져 있었는데 이번 국내연구팀(서울대-백성희교수,숙대-김근일교수) 연구로 대장암을 억제하는 기능을 한다고 밝혀졌다.
이 RORalpha는 741020 bp의 염기 서열로 이루어진 선형 DNA로써 염색체상 위치는 15번 염색체의 15q22.2 부분이다. 아래 그림에서 보면 Genomic DNA의 위치를 알 수 있다.

2.mRNA
이 그림은 mRNA를 나타낸 것으로 염색체 위의 전사가 된 부분을 의미한다.
NM 002943.3
Map 3: RefSeq Transcripts On Sequence

Region Displayed: 60,763K-60,937K bp

 이 Genomic DNA의 mRNA PCR시 필요한 PRIMER

각 primer의 start 위치는 185~186 지점으로 균일하고 GC함량의 %도 65%로 균일했다.
이 각 primer를 사용하여 mRNA를 PCR 증폭 할 수 있다.
이 그림은 mRNA를 Runblast 한것이다.
상단 부위에는 모두 RORalpha 서열이고
아랫부분에 마우스에서 발견되는 유사서열이 나타나있다. 마우스의 9번 염색체에서 발견되는 유사 서열이다.

4. cDNA
cDNA는 전사된 mRNA를 reverse transcription을 사용하여 단백질로 발현되는데 필요한 최소한의 서열을 말한다. 다음 그림은 이 ROR alpha 의 cDNA를 나타낸 그림이고 하늘색으로 표시된 서열은 alternate exon을 의미한다.
아래 그림은 CLC Genomics 프로그램으로 RORalpha의 cDNA를 나타내었고 그위에 각 제한효소 site가 표시되어 있다.

4. Activity에 대한 근거
우선 찾은 유전자에 이 신문기사에서 말하고 있는 관련 자료 같은 것이 있는지 찾아 보았다. 아래 그림에서 볼 수 있듯이 가장 최근 문서로 링크 되어 있었다.

참고 자료

없음