회사 피티 면접 발표 때 사용한 자료

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목차

1. 000을 말하다
2. 업무 경험
3. 핵심 역량

본문내용

유전체 분석 1 : TCGA database를 이용한 LIHC RNA expression 분석
TCGA(The Cancer Genome Atlas)

LIHC(Liver Hepatocellular Carcinoma) Gene expression data(FPKM) 사용

Tumor sample : 374
Normal : 50

Total : 
sample : 424
gene : 60483

Normalization : log2

Filtering option:
1)전체 sample의 절반 이상의 expression 값이 0일 때
2)전체 sample의 절반 이상의 expression 값이 NA일 때

Differential expression genes data set 형성

<중 략>

유전체 분석 2 – Tensorflow 기반 TCGA gene expression data binary classification 분석

Normal vs. Tumor T-Test 진행

Fold change cut value : 1.5
P-value < 0.05

- Total : 606 (up : 230, down : 376)