바이오인포메틱스 활용 예제
- 최초 등록일
- 2008.07.08
- 최종 저작일
- 2006.11
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소개글
바이오 인포메틱스에서 많이 사용하는 SBML(XML)을 어떻게 처리 할 수 있는 가에 대한 논문의 발표 자료이다.
또한, 유전자 온톨로지에 적용에 대한 정보를 담고 있다.
유전자 온톨리지의 적용을 적용하기 위해서 많은 고민을 했었다. 답의 의외로 간단했지만, 그간의 노력을 PPT 에 담았다.
또한 객체 지향 데이터베이스를 사용함으써 XML 형식의 파일 처리를 극대화 하고 있다.
목차
서론
연구배경
관련연구 : SBML
SBML 활용
KEGG2SBML & BioCyc2SBML
Gene Ontology
유전자 온톨로지의 사용
SBML 문서 관리기
SBMLDB에서 검색된 결과를 SBML 문서로 만드는 방법
시각화
SMS(SBML Management System) 활용 방안
SMS(SBML Management System) 발전 방향
결론 및 향후 연구
본문내용
서 론
목 표 (Goals)
여러 형태의 생화학적 네트워크 정보의 통합
대량의 SBML 문서의 효율적인 저장
데이터베이스를 이용한 SBML 문서 검색
여러 형태의 생화학적 네트워크 시각화
생화학적 네트워크의 정보교환
*관련연구 : SBML
SBML (System Biology Markup Language)
생화학적 반응에 대한 시스템을 네트워크로 묘사하고 있는 XML 기반 언어
Cell Signaling Pathways, Metabolic Pathways, Biochemical Reactions, Gene Regulation
등을 XML 문서 형식으로 기술
참고 자료
없음
