응용미생물학 정리 Microbial taxonomy (+논문소개-개미를 먹는 포유류의 장내미생물 연구)
- 최초 등록일
- 2020.12.25
- 최종 저작일
- 2020.11
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소개글
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목차
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본문내용
Phylogeny
: 특정 개체군의 evolutionary history에 대한 연구 (nucleotide sequence data 분석)
Molecular clocks (chronometer)
: evolutionary change를 측정할 때 사용하는 특정 gene 혹은 protein
Signature sequence – 일반적으로 16S rRNA gene 사용
: 특정 종만이 지니고 있는 sequence 부위 (short oligonucleotides → nucleic acid probes 혹은 PCR primers를 이용하여 추적)
FISH (fluorescent in situ hybridization)
: specific probe를 fluorescent tag하여 배양되지 않은 environmental sequences에서도 원하는 종의 유무를 판별 가능
Taxonomy: identification, classification, nomenclature
Systematics: 종간 diversitry와 relationship을 연구
FAME (Fatty acid analyses)
: 세균의 membrane lipid에 어떤 fatty acid를 가지고 있는지 분석
DDH (DNA – DNA hybridization)
: 서로 다른 종의 이중나선 DNA를 분리하여 strand끼리 결합시켜 잘 붙을수록 가까운, 같은 종임을 확인
참고 자료
Delsuc, F., Metcalf, J. L., Wegener Parfrey, L., Song, S. J., González, A., & Knight, R. (2014). Convergence of gut microbiomes in myrmecophagous mammals. Molecular ecology, 23(6), 1301-1317.
