미생물의 분류 및 확인 방법

소개글

원서 MICROBIOLOGY 를 한글로 그림첨가하여 요약 정리한 내용으로 미생물의 분류 및 미생물의 명명법
미생물의 분류 및 확인 방법에 대해 자세히 다루었다.

목차

1.THE STUDY OF PHYLOGNETIC RELATIONSHIPS
1) The three domains

2.CLASSIFICATION OF ORGANISMS
1) Scientific nomenclature
2) The taxonomic hierarchy
3) Classification of prokaryotes
4) Classification of eukaryotes
5) Classification of viruses

3.METHODS OF CLASSIFYING AND IDENTIFYING MICROORGANISMS
1) Morphological characteristics
2) Differential staining
3) Biochemical tests
4) Serology
- ELISA
- Wetern Blotting
5) Phage typing
6) Fatty acid profiles
7) Flow cytometry (유세포 분석기)
8) DNA base composition
9) DNA fingerprinting
10) The polymerase chain reaction (PCR)
11) Nucleic acid hybridization
-Southern blotting
-DNA Chips
-Ribotyping and Ribosomal RNA sequencing
12) Putting classification methods together

본문내용

5. Phage typing
• 박테리아를 감염시키는 phage를 결정하는 반응
• 특징
- phage 는 고도로 종 특이성이 있어서 한 종류의 박테리아나
한 종류의 변종만을 감염시킨다.
- 음식물과 관련된 감염 : phage typing에 의해 추적 가능
(김밥 먹고 식중독 걸렸을 때 phage 에 감염, 파괴되는
박테리아의 패턴을 비교하여 박테리아 종류를 확인가능)
- Procedures
1) Agar에 박테리아를 배양시킨다.
2) 다른 종류의 phage type 을 박테리아 위해 도포한다.
3) phage 가 박테리아를 감염, 파괴하면 growth에 깨끗한 부분이 나타난다.
6. Fatty acid profiles (FAME)
• 박테리아는 다양한 종루의 지방산을 합성하는데 이러한 지방산은 종 특이성이 있다.

7. Flow cytometry (유세포 분석기)
• 박테리아를 배양하지 않고 박테리아 확인 가능
1) 박테리아가 포함된 용액을 작은 구멍으로 흘려 보낸다.
2) cell과 주위 사이의(또는 박테리아 종 간의)
전기적인 전도도의 차이 감지에 의해 박테리아의
존재를 확인할 수 있다.
3) 구멍으로 흘러나간 용액이 laser에 맞으면
빛의 산란에 의해 cell size, shape, density,
surface에 대한 정보를 알 수 있다.
4) fluorescence는 형광을 내는 박테리아를 탐지하는데
사용 될 수 있다. (예: Pseudomonas)
세포가 선택적으로 antibody + fluorescent 에 염색
• 우유의 Listeria 균 확인에 이용

8. DNA base composition
• Guanine + cytosine moles% (GC)
• 종에 따라 base 구성은 일정하다.
• GC 함량이 10% 이상 차이 나면 다른 종이다.

9. DNA fingerprinting
• Electrophoresis of restriction enzyme digests
- 원리: 제한 효소는 DNA 분자의 특정한 부분을 모두 잘라서 restriction fragments 를 형성한다.
- 두 종류의 미생물의 DNA를 동일한 제한효소로 처리
- 생성된 제한절편을 전기영동하여 제한절편의 개수와 size 비교
- 결론 : 다른 생물로부터 생성된 제한절편을 유전적 유사성 및 차이점에 대한 정보 제공
즉, pattern 또는 DNA fingerprint가 유사할수록 더 가까운 종류의 생물
• DNA fingerprinting의 효용 : 병원성 감염 환자의 원인 진단에 사용

참고 자료

없음