PCR 다형성 분석에 의한 비늘버섯 속 계통의 유연관계 분석

최초 등록일
2016.04.02
최종 저작일
2013.06
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서지정보

발행기관 : 한국버섯학회 수록지정보 : 한국버섯학회지 / 11권 / 2호
저자명 : 권운혁, 박혁, 백민재, 조우진, 최우정, 안치범, 신도빈, 이태수

목차

ABSTRACT
서론
재료 및 방법
실험 버섯 균주
버섯균사체 배양
DNA의 추출
rDNA ITS영역의 PCR 증폭
DNA 염기서열 결정
DNA 염기서열 및 유연관계 분석
RAPD 분석
결과 및 고찰
ITS 영역의 염기서열을 이용한 유연관계 분석
RAPD를 이용한 계통분석
적요
감사의 글
참고문헌

한국어 초록

우리나라와 전 세계의 여러 지역에서 수집한 비늘버섯속 18 균주와 개암비늘버섯 2 균주를 대상으로rDNA의 ITS region 염기서열과 genomic DNA의RAPD-PCR을 수행하였다. ITS1과 ITS2영역의 염기의수는 각각 233~271, 158~233 그리고 174~219 염기쌍으로 종에 따라 변이가 있었는데 ITS2영역의 염기서열이 ITS1의 영역보다 변이가 높았고 5.8S지역의 염기의 수는 비교적 변이가 적었다. 각각의 균주 간 유연관계를 알아보기 위해 ITS영역의 염기서열을 이용하여계통도를 작성한 결과 실험에 사용한 균주는 8개의 클러스터로 나누어지는 것으로 나타났으며 동일한 종의버섯은 동일한 클러스터에 속하는 것으로 나타났다.또한 20종류의 primer를 이용하여 비늘버섯속 버섯을대상으로 RAPD-PCR을 수행한 결과 15개의 primer가효과적으로 염색체 DNA를 증폭하는 것으로 나타났다.증폭의 양상은 primer의 종류와 종에 따라 변이가 있었다. 이 결과를 토대로 계통수를 작성한 결과 계통수는 ITS 영역의 PCR 결과와 매우 유사하였다. 본 실험결과, 실험에 사용한 비늘버섯속 버섯의 종과 계통 간의 유연관계는 높았으며, rDNA ITS 영역의 염기서열분석 결과를 이용해 공시된 각각의 비늘버섯 종을 분류하는데 유용하게 사용이 가능하였다.

영어 초록

Pholiota species were collected from different geographical regions of the world. Genetic diversity and phylogenetic relationships were analyzed by rDNA-ITS sequences and RAPD polymorphism. The sizes of rDNA-ITS PCR amplicons of Pholiota spp. varied from 233~271, 158~223 and 174~219 bp, respectively. A phylogenetic tree was constructed on the ITS region sequences and Pholiota strains were classified into 8 clusters. Twenty strains in seven Pholiota spp. were classified into seven clusters by RAPD polymorphism using 15 arbitrary primers. Our experimental results suggested that rDN-ITS and RAPD analysis are useful tool for classifying Pholiota spp. and strains.

참고 자료

없음

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