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PCR 관련 퀴즈 및 정답(생화학) A+ 과제레포트2025.01.201. PCR의 3단계 procedures PCR 반응요소에는 Target DNA, Primers (oligonucleotides complementary to target), Nucleotides(dATP, dCTP, dGTP, dTTP), Thermostable DNA polymerase가 있다. PCR의 세 가지 반응 단계는 DNA 변성 (Denaturation), primer 의 Annealing, 신장 반응 (Extension)이다. DNA 변성 단계에서는 95℃의 열을 가해 DNA 이중 가닥을 분리시킨다. Annealing...2025.01.20
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아주대 생물학실험 1 생물정보학실습2025.01.121. 생물정보학 생물정보학은 생물학적 데이터를 저장, 검색, 구성하고 분석하는 데 생물공학 IT를 사용하는 분야를 일컫는다. 유전체 서열 프로젝트나 여타 연구에서 엄청난 양의 데이터가 생성되었는데, 이 데이터 웨이브의 결과 생물학 분야의 난제는 대부분 컴퓨팅 쪽 문제로 바뀌게 되었다. 생물정보학이라는 용어는 1970년 Paulien Hogeweg와 Ben Hesper가 처음 사용한 말이다. 현재는 좀 더 넓은 의미로 사용되어 컴퓨터 구조 생물학, 화학 생물학과 시스템 생물학 등을 포괄한다. 2. NCBI NCBI는 미국 국립보건원 ...2025.01.12
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생물학실험1_생물 정보학2025.05.011. 생물정보학 생물정보학은 컴퓨터를 이용하여 생물학을 연구하는 모든 분야를 포함하는 학문입니다. 생물정보학은 유전체 서열에서 유전자를 찾아내고 데이터베이스 자료와 비교하여 유사성 정도를 확인하며 유전자 산물의 구조와 기능을 예측하고 진화적인 관계를 유추하는 등 많은 일에 사용됩니다. BLAST와 같은 생물정보학 프로그램은 다양한 단백질들의 아미노산 서열이나 DNA 염기서열을 비교하는 알고리즘입니다. 이를 통해 새로운 유전자를 발견하고 유사한 유전자를 찾을 수 있습니다. 2. BLAST BLAST는 뉴클레오타이드 서열이나 아미노산 ...2025.05.01
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이화여대 생명과학실험 A+ 리포트(Simple tandem repeat를 이용한 인간유전자 분석)2025.01.231. Simple tandem repeat를 이용한 인간유전자 분석 본 실험에서는 구강 상피세포를 채취하여 PCR로 증폭시키고 PAGE를 이용하여 밴드의 발현양상을 통해 STR을 분석하였다. 인간의 유전자 sequence는 거의 유사하지만 genome상의 simple sequence가 나타나는 부위와 그 크기는 차이가 있다. Simple sequence에서 반복되는 숫자는 allele에 따라 다른데 이 부분을 DNA 비교분석으로 allelic variation을 조사하는 것이다. 밴드의 발현양상을 STR을 분석가능한데 인간의 경우에...2025.01.23
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TECAN을 이용한 DNA quality check와 전기영동을 통한 대장균의 병원성 유형 확인2025.01.121. DNA 추출 및 정제 세포로부터 DNA를 분리하기 위해서는 먼저 세포 내 DNA가 세포 밖으로 유출될 수 있도록 세포벽 및 세포막을 분해시켜야 한다. DNA 추출은 크게 세 단계로 이루어지며, sample의 세포막을 제거하는 단계인 Lysis, DNA 구조를 제외한 불순물을 제거하는 단계인 Washing, 불순물이 필터링된 DNA 샘플만을 tube에서 용출해내는 단계인 Elution이 있다. 2. DNA quality check 추출한 DNA는 DNA quality check를 해주고, Nucleic acid quantific...2025.01.12
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생물해양학 갑각류 유전자(DNA) 추출실험2025.05.111. 대립유전자 대립유전자는 상동 염색체의 같은 위치에 존재하며 하나의 형질을 결정하는 유전자이다. 상동염색체는 부모로부터 하나씩 물려받으므로 상동 염색체에 있는 대립유전자는 같을 수도 있고 서로 다를 수도 있다. 동형접합은 유전자의 유전형이 양쪽 모두 같은 경우이고, 이형접합은 유전자의 유전형이 양쪽이 서로 다른 경우이다. 동형접합과 이형접합은 유전적 다양성과 질병 발생 위험과 관련이 있다. 2. 근친계수 근친계수는 어느 개체가 가까운 인척과 근친교배된 결과 생산되었을 때, 그 근친의 정도를 표현하는 것이다. 근친계수의 수가 높을...2025.05.11
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생물정보학 보고서2025.05.111. 생물정보학 이번 실험은 생물정보학 학문을 이해하고 생물정보학 Tool을 사용하여 미지의 유전자를 데이터베이스에 대조하고 어떤 서열인지 탐구하고, 단백질 서열의 서열 유사성을 비교해보는 시간을 가졌다. BLAST 검색 결과에서 E-Value가 0에 가까울수록 쿼리 서열이 우연히 조합되어 만들어졌을 가능성이 매우 작다는 것을 의미하며, 이는 해당 서열이 중요한 상보성을 가지고 있다는 것을 나타낸다. 이번 실험을 통해 생물정보학 도구를 활용하여 미지의 유전자와 단백질 서열을 분석하고 비교할 수 있었다. 1. 생물정보학 생물정보학은 ...2025.05.11
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PCR을 이용한 유전자 증폭 실험 예비 보고서2025.01.031. PCR(중합효소 연쇄반응) PCR은 단백질(표적 핵산)을 증폭해서 검출하는 검사법으로, 두 개의 primer(시발체) 사이에 낀 DNA를 시험관 내에서 대량(20만~50만배)으로 증폭시킬 수 있는 혁명적인 방법입니다. PCR은 DNA의 해리(denaturation), primer와 주형 DNA의 결합(Annealing), DNA의 신장(Extension)의 3단계로 이루어지며, 이를 1 cycle로 하여 2의 제곱으로 증폭됩니다. PCR은 생물의 분류, 의료(유전병 진단), 범죄 수사(DNA 지문 분석) 등 DNA를 취급하는 ...2025.01.03
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PCR 결과 확인(전기영동)2025.01.181. PCR(Polymerase Chain Reaction) PCR(polymerase chain reaction)법은 DNA 또는 RNA의 특정영역을 시험관 내에 대량으로 증폭하는 기술이다. PCR은 Denaturation, Primer Annealing, Strand Extension의 세 가지 단계로 이루어지며 세단계가 한번 반복될 때마다 처음 양의 2배로 DNA 양이 증폭된다. PCR에 사용되는 중합효소는 Taq 1 polymerase로 이것은 Thermus aquaticus로부터 추출한 효소이다. PCR 반응 산물은 seq...2025.01.18
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인천대학교 나노바이오실험(1) Bioinformation2025.01.141. Bioinformatics 바이오인포매틱스(bioinformatics)는 생물학적인 문제를 응용수학, 정보과학, 통계학, 컴퓨터 과학, 인공지능, 화학, 생화학 등을 이용하여 주로 분자 수준에서 다루는 학문이다. 주 연구 분야는 서열 정렬, 유전자 검색, 유전자 조합, 단백질 구조 정렬, 단백질 구조 예측, 유전자 발현의 예측, 단백질 간 상호작용, 진화모델 등 다양하다. 2. NCBI NCBI는 미국의 대표적 국가 생정보학 기관으로, NCBI의 Gene에서 target 유전자를 검색하고 FASTA를 클릭하면 sequence ...2025.01.14
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