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RT(역전사효소) PCR 실험 보고서2025.05.141. Reverse Transcriptase (RT) Reverse Transcription 과정을 통해 RNA 주형가닥으로부터 상보적인 DNA(cDNA)를 생성하는 효소. 1970년 RDDP의 발견 이후 눈부신 발전으로 역전사바이러스학과 암 유전학의 토대가 되어왔다. 3가지 효소활성 domain을 가지며, RNA 의존성 DNA polymerase(RDDP), C말단의 RNaseH, DNA 의존성 DNA Polymerase(DDDP)이다. 교정기능(Proofreading)이 없어 돌연변이의 누적이 쉽다. 2. One/Two step...2025.05.14
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유전자 발현 분석을 위한 RT-PCR 실험2025.01.041. PCR (중합효소 연쇄반응) PCR은 target DNA의 특정 염기서열을 복제하는 기술로, template DNA, primer, dNTP, DNA 중합효소 등이 필요합니다. 온도 조절을 통해 DNA 변성, primer 결합, 신장 단계를 반복하여 DNA 단편을 기하급수적으로 증폭할 수 있습니다. 2. real-time PCR real-time PCR은 PCR 과정 중 증폭되는 DNA를 실시간으로 모니터링할 수 있는 기술입니다. 형광 검출법을 사용하여 증폭되는 DNA 양을 정량적으로 분석할 수 있습니다. 이를 통해 초기 DN...2025.01.04
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[생물공정실험] 3주차 Gene expression analysis by RT-PCR 예비보고서2025.04.261. cDNA 정의 및 합성 방법 cDNA(complementary DNA)는 RNA를 주형으로 역전사효소와 DNA 중합효소에 의해 합성된 DNA입니다. 역전사효소를 이용한 cDNA 합성에서는 RNA와 annealing 위치에 따라 3종류의 primer를 사용할 수 있습니다. (1) 역전사 효소 (reverse transcriptase; RTase), (2) RT반응에 사용하는 primer (oligo dT primer, random primer, gene-specific primer). 2. Downstream applicatio...2025.04.26
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Delavirdine 합성 가능 메커니즘2025.01.291. Delavirdine Delavirdine는 HIV-1 감염 치료에 사용되는 비뉴클레오사이드 역전사효소 억제제입니다. 이 약물은 역전사효소를 억제하여 바이러스 RNA를 DNA로 전사하는 과정을 차단함으로써 HIV 복제를 억제합니다. Delavirdine의 분자 구조에는 피리딘 고리, 술폰아미드 그룹, 아민 그룹, 방향족 고리 등의 다양한 작용기가 포함되어 있습니다. Delavirdine의 합성에는 여러 가지 방법이 있으며, 이 문서에서는 두 가지 방법을 설명합니다. 첫 번째 방법은 메틸 피루베이트와 N-(4-아미노페닐)메탄술폰...2025.01.29
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생화학 실험 보고서 - PCR2025.01.271. PCR(Polymerase Chain Reaction) PCR은 중합효소 연쇄반응으로, 열을 가하여 DNA의 특정 부분을 증폭시키는 기술이다. reverse transcription PCR은 mRNA에 대해 PCR을 적용하기 위한 방법으로, mRNA를 역전사시켜 cDNA를 합성하고 primer와 DNA polymerase를 이용해 DNA의 일부분을 복제, 증폭시킨다. PCR은 Denaturation, Annealing, Extension의 3단계로 진행되며, 주형 DNA, primer, dNTP, DNA polymerase가 ...2025.01.27
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생물공정실험 예비보고서_RNA Extraction and Quantification2025.01.071. 유전자 발현과 조절 유전자 발현 경로는 전사와 번역으로 나뉘며, 전사 개시, 전사 후 가공, 번역 단계에서 조절될 수 있다. 전사 활성은 크로마틴 구조 변화, 전사인자 결합 등으로 조절되며, 전사 후에는 mRNA 가공, 번역에서는 mRNA 사용 속도 조절 등으로 이루어진다. 2. TRIzol을 이용한 RNA 추출 TRIzol 시약은 페놀-구아니딘 이소티오시아네이트로 구성되어 세포막을 파괴하고 RNase를 억제하여 RNA를 선택적으로 추출할 수 있다. 세포 용해액을 원심분리하면 RNA가 수용층에 존재하게 되며, 이후 isopro...2025.01.07
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Reverse Transcription PCR 보고서2025.05.131. PCR의 정의 PCR은 Polymerase chain reaction으로 중합효소 연쇄반응을 말한다. DNA 분자 상에서 어떤 부분만의 염기서열을 증폭시켜 적은 양의 DNA로도 PCR을 통해 많은 DNA copy를 만들어 낼 수 있다. 2. PCR의 원리 및 방법 PCR은 DNA 가닥을 분리하고, primer가 주형가닥의 상보적인 염기서열에 결합하도록 한 후, Taq polymerase에 의해 새로운 DNA 가닥이 합성되는 과정을 반복하여 많은 DNA 단편을 복사해 내는 기술이다. 3. PCR의 이용 PCR은 의학적 진단, 유...2025.05.13
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칵테일요법2025.04.301. 에이즈(AIDS) 치료 에이즈(AIDS)는 HIV(human immunodeficiency virus)라는 바이러스에 의해 유발되며, 에이즈 치료를 위해 세 가지 이상의 약제를 동시에 복용하는 '칵테일 요법'이 가장 우수한 효과를 가지고 있다. 이 요법은 HIV를 퇴치하는 약이 아직 개발되지 않은 상황에서, 바이러스 증식을 억제하는 효소 억제제를 사용하여 바이러스 수를 감소시키고 면역 기능을 회복시키는 것을 목적으로 한다. 2. 항HIV 약제의 분류 항HIV 약제는 크게 세 가지로 분류된다. 첫째는 뉴클레오사이드 역전사 효소 ...2025.04.30
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프라임 에디터: 차세대 유전자 교정 기술의 발전과 과제2025.01.031. 유전자 가위 기술 유전자 가위 기술은 DNA nuclease 기능을 갖는 단백질 복합체를 이용하여 유전체 특정 부위에 DNA의 삽입, 결손 및 치환을 유도하여 돌연변이를 일으키는 기술을 말한다. 이 기술은 세대를 거치며 발전해왔으며, 현재 제4세대 기술인 프라임 에디터가 주목받고 있다. 프라임 에디터는 기존 유전자 가위 기술의 한계를 보완하여 다양한 크기의 DNA 결실 및 삽입, 정확한 염기 치환 등이 가능하다. 2. 프라임 에디터의 기술적 특징 프라임 에디터는 Cas9 nickase와 역전사 효소, 그리고 pegRNA(pri...2025.01.03
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식품 생화학 실험 real time qPCR과정과 결과값2025.01.141. GAPDH GAPDH 유전자는 glyceraldehyde-3-phosphate 탈수소효소 단백질 계열의 구성원을 암호화한다. 암호화된 단백질은 기계적으로 구별되는 능력을 기반으로 월광 단백질로 확인되었다. 이 유전자의 산물은 무기 인산염과 nicotinamide adenine dinucleotide (NAD)의 존재 하에서 glyceraldehyde- 3-phosphate의 가역적 산화적 인산화인 탄수화물 대사에서 중요한 에너지 생성 단계를 촉매한다. 암호화된 단백질은 핵에서 uracil DNA glycosylase 활성을 갖...2025.01.14
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