[생물학] DNA chip

목차

Ⅰ. DNA chip의 개념
Ⅱ. DNA chip 국내외 기술동향
Ⅲ. 결어

본문내용

2. DNA chip의 종류

DNA chip은 붙이는 유전물의 크기에 따라 oligonucleotide chip과 cDNA chip으로 구분할 수 있다. cDNA chip에는 최소한 500bp이상의 유전자가 붙여져 있고 oligonucleotide chip에는 15~25개의 염기들로 이루어진 oligonucleotide가 놓여있다. 각chip에 장단점이 있는데 우선 oligonucleotide chip은 정확한 염기서열을 알고 있기 때문에 하나의 염기 변화에 의한 다양성에 대한 연구( SNPs, single nucleotide polymorphisms)도 가능하다. 그러나, 실제로 몇 kb나 되는 gene에서 극히 일부인 25개 정도의 염기만을 살피는 것이므로 어느 부분을 선택하느냐가 문제가 된다. cDNA chip의 경우에는 염기 자체가 크기 때문에 전반적인 gene expression 연구에 쓰는데는 문제가 없지만 SNPs를 볼 수는 없다. 특히 cDNA chip은 두 가지의 다른 환경에서 유전자의 발현정도를 비교하는데 유리하다. Oligonucelotide chip은 미국의 Affymetrix와 Nanogen과 같은 회사에서 제작하고 있다. Affymetrix에서는 photosynthesis를 통해 DNA chip substrate 위에 직접 oligonucleotide를 합성하고 있으며, Nanogen에서는 oligonucleotide 합성하고 전기장을 이용해서 chip 위의 특정 위치에 이것들을 배열시킨다. cDNA chip은 stanford 대학에서 처음 개발되었고 pin spotting과 inkjet 방식으로 만들고 있다.

참고 자료

· DNA학 입문 야나기다 미쓰히로 전파과학사 1987
· http://www.postech.ac.kr/chem/labbi/lab/dnachip2.htm
· http://bioneer.kaist.ac.kr/~sclee/bs110/chap18/18.html#anchor1
· http://bioaio.hihome.com/main.html
· http://cvs2.khu.ac.kr/~heoni/
· http://www.bmelab.co.kr/bmelab.asp