<SSR 마커를 사용하여 아프리카, 아시아, 유럽, 남지, 오세아니아로부터> 논문 해석 레포트입니다
- 최초 등록일
- 2012.07.05
- 최종 저작일
- 2012.07
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소개글
논문 해석 레포트입니다
고찰 까지 첨부했습니다
목차
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본문내용
본 연구에서는 29개의 간단한 시퀀스 반복(SSR)마커를 사용하여 40개의 아프리카, 아시아, 유럽, 남미, 오세아니아 다른 기원에서 125 쌀 가입의 구조의 유전적 다양성과 인구를 분석하는데 사용되었습니다. 333 대립 유전자의 총 현장 당 11.5의 평균과 함께 발견되었습니다. 가장 높은 뜻(PIC)은, 유럽 남미에 0.59, 0.53, 그리고 오세아니아에 0.47.아프리카 0.66 뒤에, 아시아 0.71되었다. 스테이프 시리얼 작물로서 쌀은 세계 인구의 50% 이상과 세계의 많은 지역에서 인간의 식생활에서 가장 중요한 요소입니다. SRs는 SSR의 loci에서 다형성의 높은 수준 때문에 해석 인구 구조의 측면에서 다른 마커보다 훨씬 더 큰 해상도를 제공 합니다.
재료 및 방법
식물재료 125 쌀 가입 총은 아프리카, 아시아, 유럽, 남미, 오세아니아 등 그들의 기원에 의해 선택되었습니다. 모든 가입은 한국의 농촌 개발 행정의 국립 농업 생물 다양성 센터 (http://genebank.rda.go.kr),에서 지원받아 진행되었습니다.
DNA추출 및 SSR분석. DNA는 DNA 추출 키트를 사용하여 각 가입의 15 일 된 모종을 냉동 건조 나뭇잎에서 발췌했습니다. 상대 순결과 추출된 DNA의 농도는 다음 NanoDrop 노스다코타 - 1000 를 사용하여 확인되었습니다. 마지막으로, DNA의 농도는 20μl씩 조정했습니다. 총 29 마이크로 위성 마커의 높은 처리량은 제노 타이핑을통해 쌀 유전자지도에서 자신의 위치와 그들의 적합성에 따라 선정되었습니다(Table 2). 두 개의 다른 마커 유형 SSR의 분석에 사용되었습니다. 세 개의 프라이머 시스템은 M13 oligo - 뉴클레오 티드를 (TGTAAAACGACGGCCAGT) 형광 염료와 레이블에 포함된 것을 사용하여 6 -FAM(파란색), NED(녹색), 또는 HEX(노란색), PCR 제품은 전기 영동하는 동안 동시에 세 개를 할수 있습니다.
데이터 분석 대립 유전자 (A4), allele 빈도, 주요 allele 주파수, 유전자 다양성 (GD), 그리고 다형성 정보 콘텐츠 (PIC)의 총 수를 포함한 각 microsatellite 현장에서 다양성 측정을 위한 기본 통계, 유전자 분석 패키지를 사용하여 계산되었습니다. 가입 각 쌍 사이의 유전 거리는 PowerMarker에 V3.25를 사용하여 공유 allele 주파수를 계산하여 측정했다. 이 모델에서는 인구 (K)의 숫자는 각각의 현장에서 allele 주파수의 집합이 특징이고, 각각의 선물로 간주됩니다.
참고 자료
없음