[생물정보학]p53유전자를 이용한 쥐목 동물의 계통 분류

소개글

p53유전자를 이용한 쥐목 동물의 계통 분류

목차

Ⅰ.서론
Ⅱ.재료 및 방법
Ⅲ. 결과
1. 9종(In group: 쥐목 6종, Out group: 토끼목, 우제목, 식육목 3종) alignment
2. Neighbor-joining(Nucleotide: Kimura 2-parameter, Amino Acid : No. of differencesr)
3. Cytb유전자를 이용한 Neighbor-joining(Nucleotide: Kimura 2-parameter)
4. 9종 Maximum Parsimony(Max-mini branch-&-bound)

Ⅳ. 고찰

## 참고 문헌

본문내용

Ⅰ.서론
p53은 유전자의 전사, DNA의 치유, 세포 주기 조절, 유전자의 항상성 유지 등 수많은 세포 내 기초 활력을 유지시키는 기능을 가지고 있다. 또 p53 단백질은 손상된 DNA를 복구하거나 손상된 세포들의 apoptosis를 일으킨다. 즉, 세포의 비정상적인 분열과 증식을 억제하며, DNA가 손상되었을 때에 이를 정상적으로 복구하는 파괴하는 기능을 수행하고, DNA가 무제한적으로 증폭되는 것을 막는 인체의 대표적 암 억제 유전자이다. 이 유전자는 어류, 양서류, 특히 포유류 동물에서 기능 및 염기서열 연구 조사 되어지고 있다.
많은 연구자들은 유전자의 분자계통분류학적 연구를 위해서 성장호르몬, 미토콘드리아 DNA 등을 이용하여 연구하고 있으나, 최근에 와서 기능학적면을 갖는 유전자를 분자계통학적 연구에 이용하고 있다.

본 조사에서는 p53 유전자를 이용한 쥐목 동물의 분류체계를 정립하고자 한다.

쥐목은 척삭동물문(Chordata), 척추동물아문(Vertebrata), 포유강(Mammalia)에 속해있으며, 매우 작은 크기 내지 중간 크기의 포유류이다. 앞니는 아래 ․ 위 각각 1쌍이고 일생 동안 자라며, 끌 모양이고 앞면에만 에나멜질이 있다. 송곳니는 없고, 앞니와 앞어금니 사이에 넓은 틈이 있다. 전 세계에 29과 2,015종이 있고, 한국에는 3과 18종이 알려져 있다.

이번 계통학적 분류에서는 쥐목 동물 6종을 In group를 설정하였으며 Out Group으로 토끼목 토끼과 Oryctolagus cuniculus종과 우제목 멧돼지과 Sus scrofa종, 식육목 고양이과 Felis catus3종에 대한 조사를 하였다. 여기서 Out Group으로 선택한 토끼목 토끼과 Oryctolagus cuniculus종이 쥐목과 유사성을 보여 2차 조사하였다. p53(종양억제유전자)유전자의 기능

암은 세포의 증식과 생존에 대한 제재로부터 세포를 자유롭게 해주는 돌연변이로 인해 야기된다. 세포에 일련의 우연한 사고로 인해 돌연변이가 일어나면, 정상적인 제재 없이 증식할 수 있는 능력을 갖게 된다. 그 자손 또한 돌연변이를 물려받고 무한정 자랄 수 있는 악성종양을 형성하는 것이다.

종양억제유전자는 정상적인 세포에서 무분별한 세포의 분열과 성장을 억제하는 기능을 가진 유전자로 암의 발생에서 중요한 역할을 한다. 이들 유전자의 기능이 소실될 경우에는 세포가 과잉 성장하여 암이 유발될 수 있다. 종양억제유전자는 유전성 암과 밀접한 관계가 있다. 유전성 암의 일종인 망막아세포종(망막 중에서 주로 망막아세포에 발생하는 악성종양)은 종양억제유전자의 하나가 선천적으로 파괴되어 유전됨으로써 발병한다. 이 유전자가 포함된 염색체 부위의 손실과 돌연변이에 의한 염기치환 등은 유전자의 기능을 변화시킨다.
대표적인 종양억제유전자인 p53은 세포의 비정상적인 분열과 증식을 억제하며 세포 DNA가 손상되었을 때에 이를 정상적으로 복구하는 기능을 수행하고, DNA가 무

참고 자료

(1) 정성훈 ․ 김정용 ․ 기근홍, 2002. 대장 직장암에서 Inducible Nitric Oxide Synthase 및 p53 발현의 임상적 관련성

(2) http://www.ncbi.nlm.nih.gov

(3) 고범석, 2003. 실고기어류(Syvgnathids)의 분자계통분류학적 연구

(4) http://bric.postech.ac.kr/webzine/content/review/eco_evolution/2003/12/12.html#104