생화학 단백질: 1차 구조와 생물학적 기능

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본문내용

[Proteins : amino acid의 선형 중합체]
* Protein
: amino acid가 covalent peptide bond에 의해 연결된 unbranched polymer
* Peptide bond
: carboxyl O와 amide H가 trans conformation → 공간학적 안정
: partial(40%) double bond - 부분적 이중결합. single bond도 double bond도 아냐
- ~0.133nm long (single bond ; 0.145nm, double bond ; 0.125nm)
- peptide bond를 이루는 6개의 원자들이 동일 평면에 존재
; C와 O 사이가 순수한 이중결합이라면 자유롭게 회전 可 but 동일평면 → 회전되지 않고 고정
- polypeptide 골격이 상대적 극성을 띤다 (N ; partially positive/O ; partially negative)
(Peptide)
: 몇 개의 amino acid로 구성된 짧은 중합체
: each unit - amino acid residue
: depeptide, tripeptide, tetrapeptide, etc.

<중 략>

[Amino acid analysis of proteins]
* protein → acid hydrolysis (6N HCl, heating 110℃ 20~90 hr) → 산분해 일어나 각각의 amino acid로 떨어져. peptide bond cleavage
* ion exchange chromatography : 각각의 amino acid 성분 분리
* quantification : Ninhydrin reaction 농도측정
* amino acid composition of some proteins
: ribonuclease - 12.6kD, 124 amino acid / Trp 無
: collagen - 높은 비율의 Gly, Pro ; 약 32.7, 22.5% amino acid 서열이 (Gly-X-Pro) / 1,052 amino acid.
: Histon H3 - 다량의 basic amino acid (Arg, Lys) / 135 amino acid / 핵에서 DNA와 결합해 packing, 안정화 시켜

참고 자료

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