분자유전학 연구에 이용되는 기술

소개글

분자유전학의 연구에 이용되는 기술 중 한가지인 NGS에 대한 조사보고서 입니다.

목차

[1] 서론 - NGS 및 기타 기술들에 대한 간략한 소개

[2] 본론
1.NGS에 쓰이는 장치
2.NGS기술의 원리
1)샘플확보와 DNA추출
2)Library 제작
3)클러스터생성
4)Mapping
5)Variant Calling(염기서열변이정보 추출)
6)Annotation(염기서열변이정보 주석)
3.NGS의 응용

[3] 결론

본문내용

분자유전학 연구에는 가장 대표적인 GWAS(Genome-Wide association study), NGS(Next-Generation sequencing technology), SND 고속검색기술, FISH technology(Fluorescent in situ hybridization technology)와 얼마 전 서울대학교 김진수 교수팀이 개발한 표적 DNA 염기서열만 선택적으로 잘라 교정하는 유전자 가위기술 등 많은 기술이 사용되고 있다. 게놈연구의 속도에 박차를 가한 점 때문에 개인의 유전체를 분석할 수 있고 염기서열을 결정할 수 있는 NGS에 많은 관심이 갔다. NGS의 원리와 장비, NGS의 응용에 대해서 다루었다.

<중 략>

1)샘플확보와 DNA추출
혈액, 타액과 구강상피세포에서 sample을 확보한다. 비교적 다른 sample보다는 혈액을 많이 이용한다. DNA를 추출하기 위해 혈액sample에서 백혈구 덩어리를 분리후 부수어 DNA가 외부로 나오게 한다. DNA를 침전시켜 얻은 DNA에 알코올 처리 후 다시 침전시켜 DNA를 얻는다.

2)Library 제작
DNA sequence를 포획하는 library가 필요하다. library제작을 위해 추출한 DNA를 무작위 적으로 조각을 낸다. 절단된 DNA의 양쪽 끝에 구조를 변형시켜 ligation을 통해 Adaptor분자를 DNA와 결합시킨다. Adaptor sequence는 우리가 알고 있는 염기서열로 해독기기에서 우리가 모르는 염기서열은 인식하도록 도와주는 인식표이다. 절단된 DNA에 아답터를 붙임으로서 library를 제작한다.

3)클러스터생성
지놈의 단편의 library를 증폭하여 각각 flowcell내부에 cluster를 생성하고 해독기를 사용해 해독한다. flowcell은 oligo가 촘촘히 코팅된 유리판이다. 8줄로 되어 있어서 8종류의 DNA library가 들어갈 수 있다.

참고 자료

서울대학교 농생명과학공동기기원 최익영 교수. 차세대유전체분석기술교육.
질병관리본부 유전체센터 바이오과학정보과 권태수
Next generation sequencing and disease gene finding
(http://www.cdc.go.kr/CDC/notice/CdcKrInfo0301.jsp?menuIds=HOME001-MNU0004-MNU0036-MNU0037&cid=12639)
PGIinfo Youtube. NGS(http://www.youtube.com/watch?v=GZejHrnWUXg)
박근준. TiBMB "MicroRNA" NGS기법소개
(http://ksbmb.or.kr/webzine3/webzine_img/2012_04_img/02.pdf)